Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
HIRAP54198 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
HIRAP54198 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
HIRAP54198 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
HIRAP54198 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
HIRAP54198 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
HIRAP54198 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
HIRAP54198 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HIRAP54198 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HIRAP54198 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HIRAP54198 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HIRAP54198 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
HIRAP54198 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
HIRAP54198 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HIRAP54198 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HIRAP54198 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HIRAP54198 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
HIRAP54198 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
HIRAP54198 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
HIRAP54198 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
HIRAP54198 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
HIRAP54198 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HIRAP54198 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HIRAP54198 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HIRAP54198 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
HIRAP54198 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
HIRAP54198 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HIRAP54198 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HIRAP54198 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HIRAP54198 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HIRAP54198 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HIRAP54198 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HIRAP54198 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
HIRAP54198 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
HIRAP54198 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
HIRAP54198 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
HIRAP54198 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
HIRAP54198 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
HIRAP54198 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HIRAP54198 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HIRAP54198 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
HIRAP54198 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HIRAP54198 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
HIRAP54198 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
HIRAP54198 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
HIRAP54198 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
HIRAP54198 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
HIRAP54198 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HIRAP54198 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
HIRAP54198 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
HIRAP54198 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HIRAP54198 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
HIRAP54198 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
HIRAP54198 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
HIRAP54198 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
HIRAP54198 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
HIRAP54198 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
HIRAP54198 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
HIRAP54198 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
HIRAP54198 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
HIRAP54198 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
HIRAP54198 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC30.34■■■□□ 2.45
HIRAP54198 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
HIRAP54198 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
HIRAP54198 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
HIRAP54198 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
HIRAP54198 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC30.32■■■□□ 2.44
HIRAP54198 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
HIRAP54198 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
HIRAP54198 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
HIRAP54198 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
HIRAP54198 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
HIRAP54198 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
HIRAP54198 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
HIRAP54198 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
HIRAP54198 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
HIRAP54198 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
HIRAP54198 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HIRAP54198 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
HIRAP54198 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
HIRAP54198 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
HIRAP54198 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
HIRAP54198 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
HIRAP54198 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
HIRAP54198 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
HIRAP54198 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
HIRAP54198 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
HIRAP54198 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
HIRAP54198 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
HIRAP54198 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
HIRAP54198 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
HIRAP54198 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
HIRAP54198 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
HIRAP54198 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HIRAP54198 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
HIRAP54198 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
HIRAP54198 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HIRAP54198 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HIRAP54198 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HIRAP54198 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms