Protein–RNA interactions for Protein: P53947

YNL058C, Vacuolar membrane protein YNL058C, yeastyeast

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YNL058CP53947 RBS1YDL189W 1374 nt7.58□□□□□ -1.2
YNL058CP53947 HDA1YNL021W 2121 nt7.57□□□□□ -1.2
YNL058CP53947 UTR5YEL035C 501 nt7.57□□□□□ -1.2
YNL058CP53947 YER156CYER156C 1017 nt7.57□□□□□ -1.2
YNL058CP53947 ERG6YML008C 1152 nt7.57□□□□□ -1.2
YNL058CP53947 YKR023WYKR023W 1593 nt7.57□□□□□ -1.2
YNL058CP53947 PEX28YHR150W 1740 nt7.55□□□□□ -1.2
YNL058CP53947 DAL4YIR028W 1908 nt7.55□□□□□ -1.2
YNL058CP53947 YMR253CYMR253C 1245 nt7.55□□□□□ -1.2
YNL058CP53947 PAB1YER165W 1734 nt7.55□□□□□ -1.2
YNL058CP53947 YLR030WYLR030W 792 nt7.54□□□□□ -1.2
YNL058CP53947 ERV25YML012W 636 nt7.54□□□□□ -1.2
YNL058CP53947 APT1YML022W 564 nt7.54□□□□□ -1.2
YNL058CP53947 ATO2YNR002C 849 nt7.54□□□□□ -1.2
YNL058CP53947 TDH1YJL052W 999 nt7.53□□□□□ -1.2
YNL058CP53947 ATP2YJR121W 1536 nt7.52□□□□□ -1.2
YNL058CP53947 GFA1YKL104C 2154 nt7.52□□□□□ -1.21
YNL058CP53947 YHC3YJL059W 1227 nt7.51□□□□□ -1.21
YNL058CP53947 RTC2YBR147W 891 nt7.51□□□□□ -1.21
YNL058CP53947 AQR1YNL065W 1761 nt7.51□□□□□ -1.21
YNL058CP53947 PMT1YDL095W 2454 nt7.51□□□□□ -1.21
YNL058CP53947 DCR2YLR361C 1737 nt7.5□□□□□ -1.21
YNL058CP53947 YNL040WYNL040W 1371 nt7.5□□□□□ -1.21
YNL058CP53947 SGE1YPR198W 1632 nt7.5□□□□□ -1.21
YNL058CP53947 GNA1YFL017C 480 nt7.5□□□□□ -1.21
YNL058CP53947 CAR2YLR438W 1275 nt7.5□□□□□ -1.21
YNL058CP53947 PDC5YLR134W 1692 nt7.5□□□□□ -1.21
YNL058CP53947 TPI1YDR050C 747 nt7.49□□□□□ -1.21
YNL058CP53947 MAL31YBR298C 1845 nt7.48□□□□□ -1.21
YNL058CP53947 SNA3YJL151C 402 nt7.48□□□□□ -1.21
YNL058CP53947 YLL058WYLL058W 1728 nt7.48□□□□□ -1.21
YNL058CP53947 INP54YOL065C 1155 nt7.48□□□□□ -1.21
YNL058CP53947 YAH1YPL252C 519 nt7.48□□□□□ -1.21
YNL058CP53947 RUP1YOR138C 2016 nt7.47□□□□□ -1.21
YNL058CP53947 YDR327WYDR327W 327 nt7.47□□□□□ -1.21
YNL058CP53947 CPR2YHR057C 618 nt7.47□□□□□ -1.21
YNL058CP53947 PRY2YKR013W 990 nt7.47□□□□□ -1.21
YNL058CP53947 VPS65YLR322W 315 nt7.47□□□□□ -1.21
YNL058CP53947 FET4YMR319C 1659 nt7.47□□□□□ -1.21
YNL058CP53947 MAS2YHR024C 1449 nt7.46□□□□□ -1.21
YNL058CP53947 GET2YER083C 858 nt7.46□□□□□ -1.22
YNL058CP53947 EHD3YDR036C 1503 nt7.46□□□□□ -1.22
YNL058CP53947 STE3YKL178C 1413 nt7.45□□□□□ -1.22
YNL058CP53947 YER152W-AYER152W-A 567 nt7.45□□□□□ -1.22
YNL058CP53947 GTS1YGL181W 1191 nt7.45□□□□□ -1.22
YNL058CP53947 DAL80YKR034W 810 nt7.45□□□□□ -1.22
YNL058CP53947 ADA2YDR448W 1305 nt7.45□□□□□ -1.22
YNL058CP53947 POB3YML069W 1659 nt7.44□□□□□ -1.22
YNL058CP53947 SNF7YLR025W 723 nt7.44□□□□□ -1.22
YNL058CP53947 YPT10YBR264C 600 nt7.44□□□□□ -1.22
YNL058CP53947 SPR1YOR190W 1338 nt7.44□□□□□ -1.22
YNL058CP53947 ELP4YPL101W 1371 nt7.44□□□□□ -1.22
YNL058CP53947 YNL295WYNL295W 1575 nt7.43□□□□□ -1.22
YNL058CP53947 ACO1YLR304C 2337 nt7.43□□□□□ -1.22
YNL058CP53947 SOD2YHR008C 702 nt7.43□□□□□ -1.22
YNL058CP53947 YIA6YIL006W 1122 nt7.43□□□□□ -1.22
YNL058CP53947 YBL113CYBL113C 2379 nt7.43□□□□□ -1.22
YNL058CP53947 PNS1YOR161C 1620 nt7.42□□□□□ -1.22
YNL058CP53947 PSA1YDL055C 1086 nt7.42□□□□□ -1.22
YNL058CP53947 HNM1YGL077C 1692 nt7.41□□□□□ -1.22
YNL058CP53947 YDR215CYDR215C 414 nt7.41□□□□□ -1.22
YNL058CP53947 PPZ2YDR436W 2133 nt7.41□□□□□ -1.22
YNL058CP53947 FCP1YMR277W 2199 nt7.41□□□□□ -1.22
YNL058CP53947 ERG24YNL280C 1317 nt7.41□□□□□ -1.22
YNL058CP53947 OSM1YJR051W 1506 nt7.41□□□□□ -1.22
YNL058CP53947 PSP2YML017W 1782 nt7.41□□□□□ -1.22
YNL058CP53947 RRP43YCR035C 1185 nt7.4□□□□□ -1.22
YNL058CP53947 HAC1YFL031W 717 nt7.4□□□□□ -1.22
YNL058CP53947 PAU21YOR394W 495 nt7.4□□□□□ -1.22
YNL058CP53947 PAU22YPL282C 495 nt7.4□□□□□ -1.22
YNL058CP53947 YKR018CYKR018C 2178 nt7.4□□□□□ -1.23
YNL058CP53947 GRH1YDR517W 1119 nt7.39□□□□□ -1.23
YNL058CP53947 YER137CYER137C 447 nt7.39□□□□□ -1.23
YNL058CP53947 STS1YIR011C 960 nt7.39□□□□□ -1.23
YNL058CP53947 HRA1HRA1 564 nt7.39□□□□□ -1.23
YNL058CP53947 ARO7YPR060C 771 nt7.39□□□□□ -1.23
YNL058CP53947 CDC23YHR166C 1881 nt7.38□□□□□ -1.23
YNL058CP53947 SPS1YDR523C 1473 nt7.38□□□□□ -1.23
YNL058CP53947 MSS51YLR203C 1311 nt7.38□□□□□ -1.23
YNL058CP53947 TAD2YJL035C 753 nt7.38□□□□□ -1.23
YNL058CP53947 YJL043WYJL043W 774 nt7.38□□□□□ -1.23
YNL058CP53947 GYP8YFL027C 1494 nt7.37□□□□□ -1.23
YNL058CP53947 YBL111CYBL111C 2004 nt7.37□□□□□ -1.23
YNL058CP53947 GDH1YOR375C 1365 nt7.37□□□□□ -1.23
YNL058CP53947 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt7.37□□□□□ -1.23
YNL058CP53947 CPT1YNL130C 1182 nt7.37□□□□□ -1.23
YNL058CP53947 CAN1YEL063C 1773 nt7.37□□□□□ -1.23
YNL058CP53947 OPI1YHL020C 1215 nt7.36□□□□□ -1.23
YNL058CP53947 RPL12BYDR418W 498 nt7.35□□□□□ -1.23
YNL058CP53947 RIB1YBL033C 1038 nt7.35□□□□□ -1.23
YNL058CP53947 SEC24YIL109C 2781 nt7.34□□□□□ -1.23
YNL058CP53947 DSC3YOR223W 879 nt7.34□□□□□ -1.23
YNL058CP53947 ERV2YPR037C 591 nt7.34□□□□□ -1.23
YNL058CP53947 VBA5YKR105C 1749 nt7.34□□□□□ -1.23
YNL058CP53947 BNA3YJL060W 1335 nt7.33□□□□□ -1.24
YNL058CP53947 FRE5YOR384W 2085 nt7.33□□□□□ -1.24
YNL058CP53947 YBL070CYBL070C 321 nt7.33□□□□□ -1.24
YNL058CP53947 LIP5YOR196C 1245 nt7.33□□□□□ -1.24
YNL058CP53947 NUP53YMR153W 1428 nt7.33□□□□□ -1.24
YNL058CP53947 ATF1YOR377W 1578 nt7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 47.2 ms