Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFNA3P52797 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EFNA3P52797 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EFNA3P52797 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EFNA3P52797 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EFNA3P52797 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EFNA3P52797 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EFNA3P52797 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EFNA3P52797 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EFNA3P52797 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFNA3P52797 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFNA3P52797 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFNA3P52797 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFNA3P52797 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFNA3P52797 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFNA3P52797 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFNA3P52797 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFNA3P52797 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFNA3P52797 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFNA3P52797 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFNA3P52797 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFNA3P52797 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFNA3P52797 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFNA3P52797 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFNA3P52797 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFNA3P52797 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFNA3P52797 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EFNA3P52797 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFNA3P52797 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFNA3P52797 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFNA3P52797 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EFNA3P52797 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFNA3P52797 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFNA3P52797 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFNA3P52797 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFNA3P52797 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFNA3P52797 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFNA3P52797 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFNA3P52797 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
EFNA3P52797 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFNA3P52797 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFNA3P52797 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFNA3P52797 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFNA3P52797 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFNA3P52797 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFNA3P52797 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFNA3P52797 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFNA3P52797 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFNA3P52797 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFNA3P52797 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFNA3P52797 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFNA3P52797 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFNA3P52797 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFNA3P52797 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFNA3P52797 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFNA3P52797 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFNA3P52797 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EFNA3P52797 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFNA3P52797 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFNA3P52797 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFNA3P52797 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFNA3P52797 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFNA3P52797 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFNA3P52797 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFNA3P52797 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFNA3P52797 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFNA3P52797 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFNA3P52797 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFNA3P52797 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFNA3P52797 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFNA3P52797 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFNA3P52797 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFNA3P52797 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFNA3P52797 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFNA3P52797 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFNA3P52797 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFNA3P52797 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EFNA3P52797 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFNA3P52797 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFNA3P52797 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EFNA3P52797 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFNA3P52797 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFNA3P52797 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EFNA3P52797 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFNA3P52797 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFNA3P52797 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFNA3P52797 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFNA3P52797 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFNA3P52797 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFNA3P52797 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFNA3P52797 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFNA3P52797 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFNA3P52797 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFNA3P52797 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFNA3P52797 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFNA3P52797 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFNA3P52797 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFNA3P52797 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFNA3P52797 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFNA3P52797 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms