Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GPC3P51654 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GPC3P51654 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GPC3P51654 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GPC3P51654 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GPC3P51654 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPC3P51654 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPC3P51654 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPC3P51654 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
GPC3P51654 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GPC3P51654 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
GPC3P51654 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GPC3P51654 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GPC3P51654 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GPC3P51654 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GPC3P51654 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPC3P51654 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPC3P51654 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPC3P51654 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
GPC3P51654 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPC3P51654 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPC3P51654 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GPC3P51654 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GPC3P51654 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GPC3P51654 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
GPC3P51654 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
GPC3P51654 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GPC3P51654 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GPC3P51654 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GPC3P51654 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GPC3P51654 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GPC3P51654 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GPC3P51654 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPC3P51654 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPC3P51654 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPC3P51654 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPC3P51654 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPC3P51654 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GPC3P51654 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GPC3P51654 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GPC3P51654 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GPC3P51654 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GPC3P51654 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GPC3P51654 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GPC3P51654 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
GPC3P51654 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GPC3P51654 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GPC3P51654 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GPC3P51654 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GPC3P51654 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GPC3P51654 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GPC3P51654 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GPC3P51654 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GPC3P51654 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GPC3P51654 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GPC3P51654 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
GPC3P51654 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GPC3P51654 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GPC3P51654 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GPC3P51654 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GPC3P51654 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GPC3P51654 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPC3P51654 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPC3P51654 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
GPC3P51654 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPC3P51654 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPC3P51654 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GPC3P51654 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GPC3P51654 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GPC3P51654 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GPC3P51654 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPC3P51654 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPC3P51654 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPC3P51654 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPC3P51654 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPC3P51654 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPC3P51654 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPC3P51654 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPC3P51654 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GPC3P51654 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GPC3P51654 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GPC3P51654 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GPC3P51654 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GPC3P51654 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GPC3P51654 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GPC3P51654 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GPC3P51654 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GPC3P51654 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GPC3P51654 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GPC3P51654 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GPC3P51654 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
GPC3P51654 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GPC3P51654 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GPC3P51654 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GPC3P51654 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GPC3P51654 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GPC3P51654 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
GPC3P51654 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GPC3P51654 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GPC3P51654 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms