Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUBP50607 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUBP50607 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUBP50607 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUBP50607 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TUBP50607 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TUBP50607 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TUBP50607 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TUBP50607 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TUBP50607 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBP50607 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBP50607 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBP50607 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBP50607 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TUBP50607 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TUBP50607 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TUBP50607 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TUBP50607 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBP50607 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBP50607 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBP50607 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBP50607 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBP50607 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBP50607 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBP50607 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBP50607 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBP50607 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUBP50607 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUBP50607 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUBP50607 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUBP50607 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUBP50607 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUBP50607 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUBP50607 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBP50607 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBP50607 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBP50607 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBP50607 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBP50607 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBP50607 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBP50607 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBP50607 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBP50607 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBP50607 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBP50607 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBP50607 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBP50607 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBP50607 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBP50607 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBP50607 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUBP50607 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUBP50607 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUBP50607 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUBP50607 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBP50607 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBP50607 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBP50607 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBP50607 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBP50607 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBP50607 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBP50607 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBP50607 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBP50607 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBP50607 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBP50607 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBP50607 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBP50607 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBP50607 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBP50607 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBP50607 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TUBP50607 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TUBP50607 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBP50607 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBP50607 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBP50607 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBP50607 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBP50607 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBP50607 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBP50607 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBP50607 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBP50607 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBP50607 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBP50607 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TUBP50607 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TUBP50607 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBP50607 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBP50607 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBP50607 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBP50607 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBP50607 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBP50607 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBP50607 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBP50607 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBP50607 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBP50607 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBP50607 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBP50607 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBP50607 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBP50607 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBP50607 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms