Protein–RNA interactions for Protein: P49757

NUMB, Protein numb homolog, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUMBP49757 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NUMBP49757 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUMBP49757 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUMBP49757 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUMBP49757 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUMBP49757 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUMBP49757 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUMBP49757 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUMBP49757 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUMBP49757 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUMBP49757 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUMBP49757 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUMBP49757 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUMBP49757 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUMBP49757 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUMBP49757 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUMBP49757 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUMBP49757 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NUMBP49757 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUMBP49757 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUMBP49757 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUMBP49757 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUMBP49757 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUMBP49757 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUMBP49757 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUMBP49757 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NUMBP49757 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUMBP49757 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUMBP49757 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUMBP49757 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUMBP49757 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUMBP49757 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUMBP49757 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUMBP49757 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUMBP49757 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUMBP49757 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUMBP49757 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUMBP49757 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUMBP49757 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUMBP49757 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUMBP49757 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUMBP49757 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUMBP49757 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUMBP49757 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUMBP49757 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUMBP49757 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUMBP49757 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUMBP49757 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUMBP49757 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NUMBP49757 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUMBP49757 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NUMBP49757 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUMBP49757 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUMBP49757 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUMBP49757 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NUMBP49757 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUMBP49757 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUMBP49757 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUMBP49757 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUMBP49757 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUMBP49757 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUMBP49757 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUMBP49757 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUMBP49757 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUMBP49757 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUMBP49757 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUMBP49757 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUMBP49757 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NUMBP49757 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUMBP49757 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUMBP49757 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUMBP49757 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUMBP49757 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NUMBP49757 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUMBP49757 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUMBP49757 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUMBP49757 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUMBP49757 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUMBP49757 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUMBP49757 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUMBP49757 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUMBP49757 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUMBP49757 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUMBP49757 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUMBP49757 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUMBP49757 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUMBP49757 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUMBP49757 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NUMBP49757 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUMBP49757 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NUMBP49757 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUMBP49757 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUMBP49757 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUMBP49757 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUMBP49757 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUMBP49757 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUMBP49757 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUMBP49757 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUMBP49757 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUMBP49757 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms