Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC11A1P49279 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC11A1P49279 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC11A1P49279 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC11A1P49279 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC11A1P49279 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC11A1P49279 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC11A1P49279 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC11A1P49279 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC11A1P49279 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC11A1P49279 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC11A1P49279 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC11A1P49279 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC11A1P49279 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC11A1P49279 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC11A1P49279 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC11A1P49279 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC11A1P49279 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC11A1P49279 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC11A1P49279 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC11A1P49279 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC11A1P49279 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC11A1P49279 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC11A1P49279 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC11A1P49279 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC11A1P49279 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC11A1P49279 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC11A1P49279 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC11A1P49279 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC11A1P49279 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC11A1P49279 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC11A1P49279 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC11A1P49279 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC11A1P49279 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC11A1P49279 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC11A1P49279 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC11A1P49279 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC11A1P49279 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC11A1P49279 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC11A1P49279 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC11A1P49279 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC11A1P49279 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC11A1P49279 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SLC11A1P49279 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SLC11A1P49279 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC11A1P49279 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC11A1P49279 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC11A1P49279 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC11A1P49279 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC11A1P49279 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC11A1P49279 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC11A1P49279 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC11A1P49279 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC11A1P49279 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC11A1P49279 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC11A1P49279 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC11A1P49279 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC11A1P49279 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC11A1P49279 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC11A1P49279 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC11A1P49279 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC11A1P49279 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC11A1P49279 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC11A1P49279 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC11A1P49279 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC11A1P49279 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC11A1P49279 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC11A1P49279 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC11A1P49279 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC11A1P49279 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC11A1P49279 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC11A1P49279 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC11A1P49279 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC11A1P49279 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC11A1P49279 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC11A1P49279 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC11A1P49279 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC11A1P49279 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC11A1P49279 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC11A1P49279 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC11A1P49279 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC11A1P49279 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC11A1P49279 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC11A1P49279 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC11A1P49279 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC11A1P49279 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC11A1P49279 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC11A1P49279 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC11A1P49279 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC11A1P49279 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC11A1P49279 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC11A1P49279 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC11A1P49279 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC11A1P49279 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC11A1P49279 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC11A1P49279 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC11A1P49279 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC11A1P49279 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC11A1P49279 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC11A1P49279 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms