Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSNK1A1P48729 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSNK1A1P48729 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSNK1A1P48729 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSNK1A1P48729 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSNK1A1P48729 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSNK1A1P48729 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSNK1A1P48729 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSNK1A1P48729 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSNK1A1P48729 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSNK1A1P48729 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK1A1P48729 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK1A1P48729 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK1A1P48729 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK1A1P48729 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK1A1P48729 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK1A1P48729 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK1A1P48729 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSNK1A1P48729 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSNK1A1P48729 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSNK1A1P48729 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSNK1A1P48729 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSNK1A1P48729 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSNK1A1P48729 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSNK1A1P48729 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSNK1A1P48729 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSNK1A1P48729 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSNK1A1P48729 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSNK1A1P48729 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSNK1A1P48729 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSNK1A1P48729 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSNK1A1P48729 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSNK1A1P48729 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSNK1A1P48729 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSNK1A1P48729 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSNK1A1P48729 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSNK1A1P48729 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSNK1A1P48729 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSNK1A1P48729 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSNK1A1P48729 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSNK1A1P48729 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSNK1A1P48729 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSNK1A1P48729 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSNK1A1P48729 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSNK1A1P48729 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSNK1A1P48729 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSNK1A1P48729 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSNK1A1P48729 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSNK1A1P48729 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSNK1A1P48729 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSNK1A1P48729 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSNK1A1P48729 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CSNK1A1P48729 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSNK1A1P48729 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSNK1A1P48729 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSNK1A1P48729 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSNK1A1P48729 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSNK1A1P48729 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSNK1A1P48729 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSNK1A1P48729 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSNK1A1P48729 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CSNK1A1P48729 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSNK1A1P48729 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSNK1A1P48729 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSNK1A1P48729 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSNK1A1P48729 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSNK1A1P48729 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSNK1A1P48729 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSNK1A1P48729 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSNK1A1P48729 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSNK1A1P48729 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CSNK1A1P48729 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSNK1A1P48729 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSNK1A1P48729 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSNK1A1P48729 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSNK1A1P48729 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSNK1A1P48729 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSNK1A1P48729 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CSNK1A1P48729 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CSNK1A1P48729 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSNK1A1P48729 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSNK1A1P48729 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSNK1A1P48729 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSNK1A1P48729 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSNK1A1P48729 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSNK1A1P48729 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSNK1A1P48729 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK1A1P48729 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK1A1P48729 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK1A1P48729 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK1A1P48729 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK1A1P48729 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK1A1P48729 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSNK1A1P48729 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSNK1A1P48729 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSNK1A1P48729 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSNK1A1P48729 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSNK1A1P48729 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSNK1A1P48729 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK1A1P48729 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms