Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NRIP1P48552 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NRIP1P48552 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NRIP1P48552 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NRIP1P48552 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NRIP1P48552 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRIP1P48552 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRIP1P48552 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRIP1P48552 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NRIP1P48552 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NRIP1P48552 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NRIP1P48552 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NRIP1P48552 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NRIP1P48552 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NRIP1P48552 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NRIP1P48552 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NRIP1P48552 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NRIP1P48552 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NRIP1P48552 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NRIP1P48552 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NRIP1P48552 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NRIP1P48552 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NRIP1P48552 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NRIP1P48552 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NRIP1P48552 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NRIP1P48552 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NRIP1P48552 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NRIP1P48552 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NRIP1P48552 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRIP1P48552 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRIP1P48552 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRIP1P48552 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRIP1P48552 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRIP1P48552 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRIP1P48552 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRIP1P48552 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRIP1P48552 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRIP1P48552 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NRIP1P48552 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NRIP1P48552 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NRIP1P48552 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NRIP1P48552 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NRIP1P48552 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NRIP1P48552 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NRIP1P48552 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NRIP1P48552 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NRIP1P48552 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NRIP1P48552 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NRIP1P48552 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NRIP1P48552 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NRIP1P48552 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NRIP1P48552 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NRIP1P48552 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NRIP1P48552 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NRIP1P48552 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NRIP1P48552 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NRIP1P48552 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NRIP1P48552 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NRIP1P48552 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NRIP1P48552 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NRIP1P48552 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NRIP1P48552 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NRIP1P48552 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRIP1P48552 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRIP1P48552 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRIP1P48552 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRIP1P48552 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRIP1P48552 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRIP1P48552 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NRIP1P48552 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NRIP1P48552 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NRIP1P48552 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NRIP1P48552 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NRIP1P48552 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NRIP1P48552 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NRIP1P48552 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NRIP1P48552 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NRIP1P48552 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRIP1P48552 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRIP1P48552 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRIP1P48552 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRIP1P48552 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRIP1P48552 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NRIP1P48552 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NRIP1P48552 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NRIP1P48552 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NRIP1P48552 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NRIP1P48552 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NRIP1P48552 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NRIP1P48552 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NRIP1P48552 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NRIP1P48552 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NRIP1P48552 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NRIP1P48552 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NRIP1P48552 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NRIP1P48552 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NRIP1P48552 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NRIP1P48552 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NRIP1P48552 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NRIP1P48552 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms