Protein–RNA interactions for Protein: P43357

MAGEA3, Melanoma-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA3P43357 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MAGEA3P43357 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MAGEA3P43357 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MAGEA3P43357 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAGEA3P43357 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAGEA3P43357 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAGEA3P43357 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MAGEA3P43357 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAGEA3P43357 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAGEA3P43357 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAGEA3P43357 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAGEA3P43357 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAGEA3P43357 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAGEA3P43357 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAGEA3P43357 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAGEA3P43357 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAGEA3P43357 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAGEA3P43357 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MAGEA3P43357 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAGEA3P43357 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAGEA3P43357 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MAGEA3P43357 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MAGEA3P43357 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MAGEA3P43357 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MAGEA3P43357 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MAGEA3P43357 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAGEA3P43357 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAGEA3P43357 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAGEA3P43357 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAGEA3P43357 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAGEA3P43357 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MAGEA3P43357 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MAGEA3P43357 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MAGEA3P43357 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MAGEA3P43357 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MAGEA3P43357 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MAGEA3P43357 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MAGEA3P43357 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MAGEA3P43357 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MAGEA3P43357 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAGEA3P43357 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAGEA3P43357 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAGEA3P43357 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAGEA3P43357 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAGEA3P43357 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAGEA3P43357 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAGEA3P43357 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAGEA3P43357 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MAGEA3P43357 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MAGEA3P43357 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAGEA3P43357 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAGEA3P43357 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAGEA3P43357 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAGEA3P43357 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAGEA3P43357 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAGEA3P43357 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAGEA3P43357 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MAGEA3P43357 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAGEA3P43357 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAGEA3P43357 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAGEA3P43357 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAGEA3P43357 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAGEA3P43357 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAGEA3P43357 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAGEA3P43357 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAGEA3P43357 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAGEA3P43357 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAGEA3P43357 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAGEA3P43357 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MAGEA3P43357 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAGEA3P43357 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAGEA3P43357 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAGEA3P43357 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAGEA3P43357 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAGEA3P43357 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAGEA3P43357 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAGEA3P43357 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAGEA3P43357 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAGEA3P43357 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAGEA3P43357 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAGEA3P43357 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MAGEA3P43357 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAGEA3P43357 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAGEA3P43357 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAGEA3P43357 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAGEA3P43357 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAGEA3P43357 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAGEA3P43357 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAGEA3P43357 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAGEA3P43357 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MAGEA3P43357 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAGEA3P43357 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAGEA3P43357 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAGEA3P43357 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAGEA3P43357 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAGEA3P43357 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAGEA3P43357 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAGEA3P43357 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAGEA3P43357 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAGEA3P43357 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.5 ms