Protein–RNA interactions for Protein: P43235

CTSK, Cathepsin K, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSKP43235 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTSKP43235 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CTSKP43235 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTSKP43235 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTSKP43235 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTSKP43235 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTSKP43235 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTSKP43235 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTSKP43235 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTSKP43235 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTSKP43235 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CTSKP43235 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTSKP43235 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTSKP43235 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTSKP43235 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTSKP43235 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTSKP43235 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTSKP43235 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CTSKP43235 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTSKP43235 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTSKP43235 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTSKP43235 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTSKP43235 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTSKP43235 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTSKP43235 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTSKP43235 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTSKP43235 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTSKP43235 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTSKP43235 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CTSKP43235 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTSKP43235 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTSKP43235 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTSKP43235 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTSKP43235 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTSKP43235 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTSKP43235 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTSKP43235 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTSKP43235 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CTSKP43235 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTSKP43235 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTSKP43235 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTSKP43235 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTSKP43235 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTSKP43235 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTSKP43235 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTSKP43235 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CTSKP43235 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CTSKP43235 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTSKP43235 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTSKP43235 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTSKP43235 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTSKP43235 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTSKP43235 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTSKP43235 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CTSKP43235 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTSKP43235 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CTSKP43235 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTSKP43235 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CTSKP43235 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTSKP43235 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTSKP43235 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTSKP43235 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTSKP43235 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTSKP43235 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTSKP43235 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTSKP43235 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTSKP43235 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTSKP43235 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTSKP43235 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTSKP43235 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CTSKP43235 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CTSKP43235 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTSKP43235 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTSKP43235 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTSKP43235 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTSKP43235 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTSKP43235 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTSKP43235 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTSKP43235 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTSKP43235 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTSKP43235 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTSKP43235 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTSKP43235 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CTSKP43235 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTSKP43235 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTSKP43235 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTSKP43235 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTSKP43235 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTSKP43235 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTSKP43235 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTSKP43235 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTSKP43235 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTSKP43235 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTSKP43235 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTSKP43235 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTSKP43235 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTSKP43235 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTSKP43235 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTSKP43235 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTSKP43235 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms