Protein–RNA interactions for Protein: P42356

PI4KA, Phosphatidylinositol 4-kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4KAP42356 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PI4KAP42356 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PI4KAP42356 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PI4KAP42356 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PI4KAP42356 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PI4KAP42356 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PI4KAP42356 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PI4KAP42356 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PI4KAP42356 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PI4KAP42356 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PI4KAP42356 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PI4KAP42356 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PI4KAP42356 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PI4KAP42356 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PI4KAP42356 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PI4KAP42356 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PI4KAP42356 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
PI4KAP42356 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PI4KAP42356 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PI4KAP42356 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PI4KAP42356 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PI4KAP42356 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PI4KAP42356 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PI4KAP42356 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PI4KAP42356 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PI4KAP42356 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PI4KAP42356 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PI4KAP42356 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PI4KAP42356 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PI4KAP42356 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PI4KAP42356 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PI4KAP42356 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PI4KAP42356 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PI4KAP42356 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PI4KAP42356 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PI4KAP42356 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PI4KAP42356 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PI4KAP42356 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PI4KAP42356 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PI4KAP42356 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PI4KAP42356 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PI4KAP42356 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PI4KAP42356 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PI4KAP42356 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PI4KAP42356 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PI4KAP42356 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PI4KAP42356 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PI4KAP42356 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PI4KAP42356 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PI4KAP42356 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PI4KAP42356 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PI4KAP42356 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PI4KAP42356 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PI4KAP42356 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PI4KAP42356 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PI4KAP42356 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PI4KAP42356 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PI4KAP42356 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PI4KAP42356 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PI4KAP42356 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PI4KAP42356 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PI4KAP42356 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PI4KAP42356 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PI4KAP42356 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PI4KAP42356 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PI4KAP42356 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PI4KAP42356 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PI4KAP42356 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PI4KAP42356 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PI4KAP42356 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PI4KAP42356 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PI4KAP42356 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PI4KAP42356 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PI4KAP42356 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PI4KAP42356 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PI4KAP42356 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PI4KAP42356 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PI4KAP42356 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PI4KAP42356 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PI4KAP42356 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PI4KAP42356 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PI4KAP42356 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PI4KAP42356 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PI4KAP42356 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PI4KAP42356 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PI4KAP42356 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PI4KAP42356 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PI4KAP42356 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PI4KAP42356 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PI4KAP42356 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PI4KAP42356 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PI4KAP42356 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PI4KAP42356 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PI4KAP42356 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PI4KAP42356 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PI4KAP42356 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PI4KAP42356 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PI4KAP42356 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PI4KAP42356 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PI4KAP42356 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms