Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
KDM5CP41229 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
KDM5CP41229 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
KDM5CP41229 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38.55■■■■□ 3.76
KDM5CP41229 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
KDM5CP41229 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
KDM5CP41229 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
KDM5CP41229 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
KDM5CP41229 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
KDM5CP41229 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
KDM5CP41229 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
KDM5CP41229 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
KDM5CP41229 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
KDM5CP41229 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
KDM5CP41229 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
KDM5CP41229 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC38.51■■■■□ 3.76
KDM5CP41229 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC38.51■■■■□ 3.76
KDM5CP41229 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
KDM5CP41229 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
KDM5CP41229 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
KDM5CP41229 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
KDM5CP41229 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC38.49■■■■□ 3.75
KDM5CP41229 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
KDM5CP41229 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
KDM5CP41229 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
KDM5CP41229 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
KDM5CP41229 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
KDM5CP41229 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
KDM5CP41229 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
KDM5CP41229 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
KDM5CP41229 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
KDM5CP41229 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
KDM5CP41229 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
KDM5CP41229 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
KDM5CP41229 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
KDM5CP41229 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
KDM5CP41229 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
KDM5CP41229 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
KDM5CP41229 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
KDM5CP41229 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
KDM5CP41229 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
KDM5CP41229 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
KDM5CP41229 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
KDM5CP41229 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
KDM5CP41229 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
KDM5CP41229 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
KDM5CP41229 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
KDM5CP41229 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
KDM5CP41229 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
KDM5CP41229 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
KDM5CP41229 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
KDM5CP41229 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
KDM5CP41229 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
KDM5CP41229 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
KDM5CP41229 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
KDM5CP41229 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
KDM5CP41229 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
KDM5CP41229 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
KDM5CP41229 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
KDM5CP41229 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
KDM5CP41229 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
KDM5CP41229 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC38.38■■■■□ 3.73
KDM5CP41229 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
KDM5CP41229 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
KDM5CP41229 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
KDM5CP41229 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
KDM5CP41229 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
KDM5CP41229 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
KDM5CP41229 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
KDM5CP41229 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC38.33■■■■□ 3.73
KDM5CP41229 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC38.32■■■■□ 3.73
KDM5CP41229 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
KDM5CP41229 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
KDM5CP41229 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
KDM5CP41229 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
KDM5CP41229 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
KDM5CP41229 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
KDM5CP41229 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
KDM5CP41229 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
KDM5CP41229 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
KDM5CP41229 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
KDM5CP41229 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
KDM5CP41229 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
KDM5CP41229 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
KDM5CP41229 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
KDM5CP41229 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
KDM5CP41229 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
KDM5CP41229 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
KDM5CP41229 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
KDM5CP41229 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
KDM5CP41229 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
KDM5CP41229 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
KDM5CP41229 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
KDM5CP41229 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
KDM5CP41229 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
KDM5CP41229 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
KDM5CP41229 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
KDM5CP41229 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC38.24■■■■□ 3.71
KDM5CP41229 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
KDM5CP41229 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms