Protein–RNA interactions for Protein: P40937

RFC5, Replication factor C subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC5P40937 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RFC5P40937 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RFC5P40937 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RFC5P40937 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RFC5P40937 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RFC5P40937 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RFC5P40937 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
RFC5P40937 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RFC5P40937 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RFC5P40937 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RFC5P40937 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RFC5P40937 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RFC5P40937 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RFC5P40937 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RFC5P40937 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RFC5P40937 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RFC5P40937 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RFC5P40937 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RFC5P40937 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RFC5P40937 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RFC5P40937 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RFC5P40937 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RFC5P40937 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RFC5P40937 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RFC5P40937 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RFC5P40937 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RFC5P40937 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RFC5P40937 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RFC5P40937 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RFC5P40937 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RFC5P40937 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RFC5P40937 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RFC5P40937 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RFC5P40937 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RFC5P40937 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RFC5P40937 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RFC5P40937 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RFC5P40937 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RFC5P40937 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RFC5P40937 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RFC5P40937 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RFC5P40937 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RFC5P40937 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RFC5P40937 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RFC5P40937 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RFC5P40937 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RFC5P40937 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RFC5P40937 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RFC5P40937 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RFC5P40937 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RFC5P40937 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RFC5P40937 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RFC5P40937 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RFC5P40937 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RFC5P40937 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RFC5P40937 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RFC5P40937 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RFC5P40937 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RFC5P40937 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RFC5P40937 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RFC5P40937 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RFC5P40937 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RFC5P40937 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RFC5P40937 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RFC5P40937 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RFC5P40937 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RFC5P40937 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RFC5P40937 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RFC5P40937 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RFC5P40937 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RFC5P40937 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RFC5P40937 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RFC5P40937 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RFC5P40937 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RFC5P40937 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RFC5P40937 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RFC5P40937 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RFC5P40937 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RFC5P40937 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
RFC5P40937 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
RFC5P40937 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RFC5P40937 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RFC5P40937 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RFC5P40937 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RFC5P40937 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RFC5P40937 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RFC5P40937 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RFC5P40937 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RFC5P40937 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RFC5P40937 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RFC5P40937 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RFC5P40937 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RFC5P40937 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RFC5P40937 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RFC5P40937 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RFC5P40937 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RFC5P40937 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RFC5P40937 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RFC5P40937 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RFC5P40937 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms