Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC26A3P40879 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC26A3P40879 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC26A3P40879 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC26A3P40879 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC26A3P40879 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC26A3P40879 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC26A3P40879 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC26A3P40879 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC26A3P40879 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC26A3P40879 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC26A3P40879 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC26A3P40879 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC26A3P40879 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC26A3P40879 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC26A3P40879 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC26A3P40879 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC26A3P40879 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC26A3P40879 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC26A3P40879 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC26A3P40879 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC26A3P40879 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC26A3P40879 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC26A3P40879 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC26A3P40879 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC26A3P40879 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC26A3P40879 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC26A3P40879 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC26A3P40879 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC26A3P40879 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC26A3P40879 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC26A3P40879 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC26A3P40879 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC26A3P40879 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC26A3P40879 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC26A3P40879 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC26A3P40879 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC26A3P40879 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC26A3P40879 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC26A3P40879 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC26A3P40879 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC26A3P40879 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC26A3P40879 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC26A3P40879 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC26A3P40879 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC26A3P40879 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC26A3P40879 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC26A3P40879 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC26A3P40879 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC26A3P40879 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC26A3P40879 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC26A3P40879 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC26A3P40879 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC26A3P40879 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC26A3P40879 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC26A3P40879 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC26A3P40879 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC26A3P40879 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC26A3P40879 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC26A3P40879 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC26A3P40879 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC26A3P40879 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC26A3P40879 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC26A3P40879 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC26A3P40879 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC26A3P40879 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC26A3P40879 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC26A3P40879 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC26A3P40879 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC26A3P40879 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC26A3P40879 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC26A3P40879 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC26A3P40879 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC26A3P40879 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC26A3P40879 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC26A3P40879 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC26A3P40879 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC26A3P40879 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC26A3P40879 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC26A3P40879 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC26A3P40879 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC26A3P40879 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC26A3P40879 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC26A3P40879 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC26A3P40879 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC26A3P40879 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC26A3P40879 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC26A3P40879 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC26A3P40879 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC26A3P40879 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC26A3P40879 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC26A3P40879 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC26A3P40879 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC26A3P40879 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC26A3P40879 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC26A3P40879 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC26A3P40879 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC26A3P40879 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC26A3P40879 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC26A3P40879 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms