Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 ERG12YMR208W 1332 nt6.92□□□□□ -1.3
DDI1P40087 ENB1YOL158C 1821 nt6.92□□□□□ -1.3
DDI1P40087 YCR041WYCR041W 333 nt6.91□□□□□ -1.3
DDI1P40087 PMU1YKL128C 888 nt6.91□□□□□ -1.3
DDI1P40087 BXI1YNL305C 894 nt6.91□□□□□ -1.3
DDI1P40087 YBR232CYBR232C 360 nt6.91□□□□□ -1.3
DDI1P40087 JHD1YER051W 1479 nt6.91□□□□□ -1.3
DDI1P40087 LOT6YLR011W 576 nt6.9□□□□□ -1.3
DDI1P40087 ECM30YLR436C 3825 nt6.9□□□□□ -1.3
DDI1P40087 YDR215CYDR215C 414 nt6.89□□□□□ -1.31
DDI1P40087 YJL064WYJL064W 396 nt6.89□□□□□ -1.31
DDI1P40087 SMC5YOL034W 3282 nt6.89□□□□□ -1.31
DDI1P40087 FCY2YER056C 1602 nt6.87□□□□□ -1.31
DDI1P40087 YKL147CYKL147C 618 nt6.87□□□□□ -1.31
DDI1P40087 YMR206WYMR206W 942 nt6.87□□□□□ -1.31
DDI1P40087 YJL045WYJL045W 1905 nt6.87□□□□□ -1.31
DDI1P40087 CDC3YLR314C 1563 nt6.86□□□□□ -1.31
DDI1P40087 ERG24YNL280C 1317 nt6.86□□□□□ -1.31
DDI1P40087 YGR210CYGR210C 1236 nt6.86□□□□□ -1.31
DDI1P40087 CPR2YHR057C 618 nt6.86□□□□□ -1.31
DDI1P40087 DAL80YKR034W 810 nt6.86□□□□□ -1.31
DDI1P40087 LIP5YOR196C 1245 nt6.86□□□□□ -1.31
DDI1P40087 YGL260WYGL260W 231 nt6.85□□□□□ -1.31
DDI1P40087 YOR012WYOR012W 414 nt6.85□□□□□ -1.31
DDI1P40087 PUP1YOR157C 786 nt6.85□□□□□ -1.31
DDI1P40087 NUP57YGR119C 1626 nt6.85□□□□□ -1.31
DDI1P40087 YCR025CYCR025C 411 nt6.84□□□□□ -1.31
DDI1P40087 PAC10YGR078C 600 nt6.84□□□□□ -1.31
DDI1P40087 PAU19YMR325W 375 nt6.84□□□□□ -1.31
DDI1P40087 SKY1YMR216C 2229 nt6.84□□□□□ -1.32
DDI1P40087 RQC1YDR333C 2172 nt6.84□□□□□ -1.32
DDI1P40087 YLR112WYLR112W 420 nt6.83□□□□□ -1.32
DDI1P40087 YPR084WYPR084W 1371 nt6.82□□□□□ -1.32
DDI1P40087 EMP65YER140W 1671 nt6.82□□□□□ -1.32
DDI1P40087 HHY1YEL059W 309 nt6.82□□□□□ -1.32
DDI1P40087 SER2YGR208W 930 nt6.82□□□□□ -1.32
DDI1P40087 YPL108WYPL108W 507 nt6.82□□□□□ -1.32
DDI1P40087 HTS1YPR033C 1641 nt6.81□□□□□ -1.32
DDI1P40087 YML034C-AYML034C-A 399 nt6.81□□□□□ -1.32
DDI1P40087 PRP2YNR011C 2631 nt6.81□□□□□ -1.32
DDI1P40087 RSP5YER125W 2430 nt6.8□□□□□ -1.32
DDI1P40087 TGA1tA(UGC)A 73 nt6.8□□□□□ -1.32
DDI1P40087 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt6.8□□□□□ -1.32
DDI1P40087 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt6.8□□□□□ -1.32
DDI1P40087 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt6.8□□□□□ -1.32
DDI1P40087 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt6.8□□□□□ -1.32
DDI1P40087 AFG3YER017C 2286 nt6.8□□□□□ -1.32
DDI1P40087 EXG2YDR261C 1689 nt6.79□□□□□ -1.32
DDI1P40087 SEC23YPR181C 2307 nt6.79□□□□□ -1.32
DDI1P40087 ADE17YMR120C 1779 nt6.79□□□□□ -1.32
DDI1P40087 OPI1YHL020C 1215 nt6.78□□□□□ -1.32
DDI1P40087 SLG1YOR008C 1137 nt6.78□□□□□ -1.32
DDI1P40087 RPS6AYPL090C 711 nt6.78□□□□□ -1.32
DDI1P40087 RPS6BYBR181C 711 nt6.78□□□□□ -1.32
DDI1P40087 STE3YKL178C 1413 nt6.77□□□□□ -1.33
DDI1P40087 SGE1YPR198W 1632 nt6.77□□□□□ -1.33
DDI1P40087 KIN1YDR122W 3195 nt6.77□□□□□ -1.33
DDI1P40087 GET2YER083C 858 nt6.77□□□□□ -1.33
DDI1P40087 INP54YOL065C 1155 nt6.77□□□□□ -1.33
DDI1P40087 FCY1YPR062W 477 nt6.77□□□□□ -1.33
DDI1P40087 EFM1YHL039W 1758 nt6.77□□□□□ -1.33
DDI1P40087 CLN1YMR199W 1641 nt6.76□□□□□ -1.33
DDI1P40087 YNL295WYNL295W 1575 nt6.74□□□□□ -1.33
DDI1P40087 NMD5YJR132W 3147 nt6.74□□□□□ -1.33
DDI1P40087 RRN10YBL025W 438 nt6.74□□□□□ -1.33
DDI1P40087 VMA2YBR127C 1554 nt6.74□□□□□ -1.33
DDI1P40087 CRN1YLR429W 1956 nt6.73□□□□□ -1.33
DDI1P40087 MTR3YGR158C 753 nt6.73□□□□□ -1.33
DDI1P40087 ARC35YNR035C 1029 nt6.73□□□□□ -1.33
DDI1P40087 MCH2YKL221W 1422 nt6.72□□□□□ -1.33
DDI1P40087 CYB2YML054C 1776 nt6.72□□□□□ -1.33
DDI1P40087 SNT309YPR101W 528 nt6.71□□□□□ -1.34
DDI1P40087 BDS1YOL164W 1941 nt6.71□□□□□ -1.34
DDI1P40087 ATP2YJR121W 1536 nt6.71□□□□□ -1.34
DDI1P40087 HMS2YJR147W 1077 nt6.7□□□□□ -1.34
DDI1P40087 YPT10YBR264C 600 nt6.7□□□□□ -1.34
DDI1P40087 PET18YCR020C 648 nt6.69□□□□□ -1.34
DDI1P40087 RRP43YCR035C 1185 nt6.69□□□□□ -1.34
DDI1P40087 YER156CYER156C 1017 nt6.69□□□□□ -1.34
DDI1P40087 SUN4YNL066W 1263 nt6.69□□□□□ -1.34
DDI1P40087 SMK1YPR054W 1167 nt6.69□□□□□ -1.34
DDI1P40087 VBA5YKR105C 1749 nt6.69□□□□□ -1.34
DDI1P40087 CDC7YDL017W 1524 nt6.68□□□□□ -1.34
DDI1P40087 NTG1YAL015C 1200 nt6.68□□□□□ -1.34
DDI1P40087 TPK1YJL164C 1194 nt6.67□□□□□ -1.34
DDI1P40087 MHP1YJL042W 4197 nt6.67□□□□□ -1.34
DDI1P40087 AMN1YBR158W 1650 nt6.66□□□□□ -1.34
DDI1P40087 GRH1YDR517W 1119 nt6.66□□□□□ -1.34
DDI1P40087 SOD2YHR008C 702 nt6.66□□□□□ -1.34
DDI1P40087 YIL168WYIL168W 384 nt6.66□□□□□ -1.34
DDI1P40087 RDR1YOR380W 1641 nt6.65□□□□□ -1.34
DDI1P40087 ERS1YCR075C 783 nt6.65□□□□□ -1.34
DDI1P40087 RPL2BYIL018W 765 nt6.65□□□□□ -1.34
DDI1P40087 MGM101YJR144W 810 nt6.65□□□□□ -1.34
DDI1P40087 RIB1YBL033C 1038 nt6.65□□□□□ -1.34
DDI1P40087 YCP4YCR004C 744 nt6.64□□□□□ -1.35
DDI1P40087 MFT1YML062C 1179 nt6.64□□□□□ -1.35
DDI1P40087 DSC3YOR223W 879 nt6.64□□□□□ -1.35
DDI1P40087 ECM27YJR106W 2178 nt6.64□□□□□ -1.35
DDI1P40087 PSA1YDL055C 1086 nt6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.9 ms