Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MYH11P35749 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MYH11P35749 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MYH11P35749 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MYH11P35749 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MYH11P35749 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MYH11P35749 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
MYH11P35749 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MYH11P35749 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MYH11P35749 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MYH11P35749 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MYH11P35749 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MYH11P35749 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MYH11P35749 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MYH11P35749 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MYH11P35749 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MYH11P35749 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYH11P35749 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYH11P35749 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYH11P35749 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYH11P35749 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYH11P35749 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYH11P35749 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYH11P35749 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYH11P35749 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYH11P35749 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYH11P35749 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYH11P35749 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYH11P35749 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
MYH11P35749 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYH11P35749 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYH11P35749 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MYH11P35749 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MYH11P35749 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYH11P35749 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYH11P35749 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYH11P35749 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
MYH11P35749 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYH11P35749 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYH11P35749 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYH11P35749 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYH11P35749 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYH11P35749 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYH11P35749 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYH11P35749 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYH11P35749 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYH11P35749 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYH11P35749 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYH11P35749 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
MYH11P35749 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYH11P35749 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYH11P35749 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
MYH11P35749 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYH11P35749 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYH11P35749 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYH11P35749 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
MYH11P35749 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
MYH11P35749 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYH11P35749 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYH11P35749 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYH11P35749 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYH11P35749 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYH11P35749 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
MYH11P35749 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYH11P35749 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYH11P35749 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYH11P35749 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MYH11P35749 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MYH11P35749 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MYH11P35749 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MYH11P35749 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MYH11P35749 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MYH11P35749 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MYH11P35749 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYH11P35749 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYH11P35749 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYH11P35749 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYH11P35749 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MYH11P35749 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MYH11P35749 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MYH11P35749 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYH11P35749 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYH11P35749 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MYH11P35749 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MYH11P35749 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MYH11P35749 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYH11P35749 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYH11P35749 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYH11P35749 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYH11P35749 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
MYH11P35749 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MYH11P35749 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MYH11P35749 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MYH11P35749 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MYH11P35749 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MYH11P35749 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYH11P35749 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYH11P35749 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYH11P35749 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYH11P35749 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms