Protein–RNA interactions for Protein: P34903

GABRA3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA3P34903 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRA3P34903 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRA3P34903 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRA3P34903 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRA3P34903 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRA3P34903 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRA3P34903 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRA3P34903 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GABRA3P34903 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GABRA3P34903 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GABRA3P34903 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GABRA3P34903 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABRA3P34903 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABRA3P34903 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABRA3P34903 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABRA3P34903 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRA3P34903 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRA3P34903 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRA3P34903 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRA3P34903 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRA3P34903 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRA3P34903 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRA3P34903 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRA3P34903 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRA3P34903 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRA3P34903 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRA3P34903 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRA3P34903 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRA3P34903 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRA3P34903 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRA3P34903 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRA3P34903 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABRA3P34903 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABRA3P34903 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GABRA3P34903 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GABRA3P34903 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRA3P34903 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRA3P34903 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRA3P34903 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRA3P34903 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRA3P34903 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRA3P34903 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRA3P34903 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRA3P34903 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRA3P34903 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRA3P34903 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRA3P34903 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRA3P34903 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRA3P34903 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRA3P34903 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRA3P34903 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRA3P34903 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRA3P34903 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRA3P34903 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRA3P34903 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRA3P34903 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRA3P34903 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRA3P34903 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRA3P34903 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRA3P34903 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRA3P34903 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRA3P34903 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRA3P34903 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRA3P34903 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRA3P34903 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRA3P34903 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRA3P34903 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRA3P34903 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRA3P34903 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRA3P34903 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRA3P34903 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRA3P34903 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GABRA3P34903 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABRA3P34903 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABRA3P34903 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRA3P34903 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRA3P34903 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRA3P34903 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRA3P34903 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GABRA3P34903 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GABRA3P34903 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABRA3P34903 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABRA3P34903 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABRA3P34903 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRA3P34903 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRA3P34903 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRA3P34903 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRA3P34903 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRA3P34903 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRA3P34903 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRA3P34903 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRA3P34903 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRA3P34903 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRA3P34903 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRA3P34903 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRA3P34903 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRA3P34903 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRA3P34903 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRA3P34903 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRA3P34903 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms