Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCKARP32238 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCKARP32238 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCKARP32238 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCKARP32238 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCKARP32238 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCKARP32238 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCKARP32238 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCKARP32238 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCKARP32238 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCKARP32238 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCKARP32238 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCKARP32238 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCKARP32238 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCKARP32238 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCKARP32238 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCKARP32238 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCKARP32238 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCKARP32238 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCKARP32238 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCKARP32238 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCKARP32238 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCKARP32238 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCKARP32238 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCKARP32238 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCKARP32238 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCKARP32238 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCKARP32238 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCKARP32238 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCKARP32238 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCKARP32238 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCKARP32238 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCKARP32238 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCKARP32238 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCKARP32238 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCKARP32238 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCKARP32238 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCKARP32238 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCKARP32238 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCKARP32238 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCKARP32238 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCKARP32238 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCKARP32238 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCKARP32238 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCKARP32238 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCKARP32238 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCKARP32238 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCKARP32238 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCKARP32238 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCKARP32238 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCKARP32238 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCKARP32238 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCKARP32238 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CCKARP32238 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCKARP32238 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCKARP32238 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCKARP32238 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCKARP32238 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCKARP32238 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCKARP32238 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCKARP32238 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCKARP32238 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCKARP32238 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCKARP32238 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCKARP32238 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCKARP32238 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCKARP32238 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCKARP32238 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCKARP32238 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCKARP32238 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCKARP32238 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCKARP32238 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCKARP32238 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCKARP32238 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCKARP32238 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCKARP32238 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCKARP32238 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCKARP32238 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCKARP32238 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCKARP32238 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCKARP32238 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCKARP32238 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCKARP32238 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCKARP32238 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCKARP32238 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCKARP32238 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCKARP32238 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCKARP32238 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCKARP32238 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCKARP32238 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCKARP32238 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCKARP32238 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCKARP32238 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCKARP32238 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCKARP32238 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCKARP32238 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCKARP32238 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCKARP32238 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCKARP32238 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCKARP32238 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms