Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3AP31941 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3AP31941 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3AP31941 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3AP31941 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3AP31941 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3AP31941 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3AP31941 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3AP31941 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3AP31941 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3AP31941 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3AP31941 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3AP31941 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3AP31941 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
APOBEC3AP31941 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3AP31941 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3AP31941 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3AP31941 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3AP31941 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC3AP31941 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC3AP31941 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC3AP31941 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3AP31941 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3AP31941 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3AP31941 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3AP31941 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3AP31941 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3AP31941 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3AP31941 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC3AP31941 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC3AP31941 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC3AP31941 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC3AP31941 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC3AP31941 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC3AP31941 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3AP31941 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3AP31941 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3AP31941 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3AP31941 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3AP31941 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3AP31941 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3AP31941 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3AP31941 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3AP31941 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3AP31941 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3AP31941 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3AP31941 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3AP31941 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3AP31941 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3AP31941 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3AP31941 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3AP31941 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3AP31941 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3AP31941 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3AP31941 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3AP31941 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3AP31941 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3AP31941 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3AP31941 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3AP31941 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3AP31941 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3AP31941 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3AP31941 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3AP31941 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3AP31941 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3AP31941 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
APOBEC3AP31941 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3AP31941 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3AP31941 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3AP31941 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3AP31941 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3AP31941 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3AP31941 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3AP31941 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3AP31941 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3AP31941 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3AP31941 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3AP31941 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3AP31941 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3AP31941 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3AP31941 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3AP31941 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3AP31941 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3AP31941 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3AP31941 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3AP31941 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC3AP31941 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3AP31941 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3AP31941 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3AP31941 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3AP31941 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3AP31941 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3AP31941 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3AP31941 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOBEC3AP31941 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOBEC3AP31941 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3AP31941 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3AP31941 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3AP31941 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3AP31941 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms