Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CTGFP29279 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTGFP29279 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTGFP29279 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTGFP29279 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTGFP29279 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CTGFP29279 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CTGFP29279 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CTGFP29279 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CTGFP29279 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CTGFP29279 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CTGFP29279 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CTGFP29279 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CTGFP29279 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CTGFP29279 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CTGFP29279 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTGFP29279 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTGFP29279 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTGFP29279 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTGFP29279 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTGFP29279 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTGFP29279 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTGFP29279 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTGFP29279 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTGFP29279 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTGFP29279 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTGFP29279 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTGFP29279 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTGFP29279 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTGFP29279 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTGFP29279 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTGFP29279 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTGFP29279 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTGFP29279 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTGFP29279 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTGFP29279 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTGFP29279 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTGFP29279 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTGFP29279 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTGFP29279 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTGFP29279 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTGFP29279 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTGFP29279 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTGFP29279 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTGFP29279 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CTGFP29279 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTGFP29279 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CTGFP29279 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTGFP29279 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTGFP29279 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTGFP29279 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTGFP29279 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTGFP29279 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CTGFP29279 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CTGFP29279 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CTGFP29279 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CTGFP29279 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CTGFP29279 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CTGFP29279 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CTGFP29279 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CTGFP29279 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CTGFP29279 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CTGFP29279 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CTGFP29279 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CTGFP29279 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTGFP29279 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTGFP29279 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTGFP29279 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTGFP29279 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CTGFP29279 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
CTGFP29279 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTGFP29279 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTGFP29279 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTGFP29279 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTGFP29279 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CTGFP29279 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTGFP29279 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTGFP29279 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTGFP29279 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTGFP29279 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTGFP29279 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTGFP29279 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTGFP29279 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTGFP29279 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTGFP29279 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTGFP29279 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTGFP29279 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTGFP29279 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTGFP29279 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CTGFP29279 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CTGFP29279 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTGFP29279 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTGFP29279 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTGFP29279 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTGFP29279 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTGFP29279 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTGFP29279 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTGFP29279 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTGFP29279 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CTGFP29279 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms