Protein–RNA interactions for Protein: P27797

CALR, Calreticulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALRP27797 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALRP27797 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALRP27797 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALRP27797 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALRP27797 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALRP27797 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALRP27797 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALRP27797 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALRP27797 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALRP27797 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALRP27797 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALRP27797 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALRP27797 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CALRP27797 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CALRP27797 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CALRP27797 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CALRP27797 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CALRP27797 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CALRP27797 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CALRP27797 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CALRP27797 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CALRP27797 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CALRP27797 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CALRP27797 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CALRP27797 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CALRP27797 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CALRP27797 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CALRP27797 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CALRP27797 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CALRP27797 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CALRP27797 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALRP27797 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALRP27797 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALRP27797 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALRP27797 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALRP27797 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CALRP27797 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CALRP27797 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CALRP27797 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CALRP27797 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CALRP27797 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CALRP27797 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALRP27797 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALRP27797 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALRP27797 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALRP27797 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALRP27797 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALRP27797 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALRP27797 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CALRP27797 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CALRP27797 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CALRP27797 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALRP27797 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALRP27797 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALRP27797 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALRP27797 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALRP27797 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALRP27797 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALRP27797 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALRP27797 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALRP27797 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CALRP27797 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALRP27797 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALRP27797 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALRP27797 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALRP27797 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALRP27797 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALRP27797 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALRP27797 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALRP27797 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALRP27797 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALRP27797 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALRP27797 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALRP27797 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALRP27797 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CALRP27797 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALRP27797 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALRP27797 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALRP27797 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CALRP27797 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALRP27797 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALRP27797 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALRP27797 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALRP27797 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALRP27797 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALRP27797 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CALRP27797 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALRP27797 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALRP27797 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALRP27797 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALRP27797 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALRP27797 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALRP27797 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALRP27797 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALRP27797 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALRP27797 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALRP27797 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALRP27797 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALRP27797 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALRP27797 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms