Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MARK3P27448 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MARK3P27448 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MARK3P27448 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MARK3P27448 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MARK3P27448 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MARK3P27448 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MARK3P27448 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MARK3P27448 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MARK3P27448 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MARK3P27448 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MARK3P27448 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MARK3P27448 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MARK3P27448 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MARK3P27448 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MARK3P27448 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MARK3P27448 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MARK3P27448 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MARK3P27448 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MARK3P27448 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MARK3P27448 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MARK3P27448 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MARK3P27448 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MARK3P27448 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MARK3P27448 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MARK3P27448 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MARK3P27448 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MARK3P27448 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MARK3P27448 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MARK3P27448 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MARK3P27448 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MARK3P27448 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MARK3P27448 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MARK3P27448 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MARK3P27448 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MARK3P27448 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MARK3P27448 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MARK3P27448 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MARK3P27448 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MARK3P27448 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MARK3P27448 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MARK3P27448 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MARK3P27448 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MARK3P27448 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MARK3P27448 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MARK3P27448 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MARK3P27448 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MARK3P27448 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MARK3P27448 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MARK3P27448 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MARK3P27448 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MARK3P27448 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MARK3P27448 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MARK3P27448 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MARK3P27448 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MARK3P27448 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MARK3P27448 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MARK3P27448 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MARK3P27448 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MARK3P27448 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MARK3P27448 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MARK3P27448 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MARK3P27448 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MARK3P27448 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MARK3P27448 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MARK3P27448 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MARK3P27448 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MARK3P27448 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MARK3P27448 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MARK3P27448 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MARK3P27448 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MARK3P27448 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MARK3P27448 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MARK3P27448 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
MARK3P27448 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MARK3P27448 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MARK3P27448 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MARK3P27448 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MARK3P27448 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MARK3P27448 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MARK3P27448 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MARK3P27448 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MARK3P27448 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MARK3P27448 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MARK3P27448 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MARK3P27448 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MARK3P27448 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MARK3P27448 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MARK3P27448 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MARK3P27448 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
MARK3P27448 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MARK3P27448 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MARK3P27448 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MARK3P27448 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MARK3P27448 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MARK3P27448 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MARK3P27448 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MARK3P27448 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
MARK3P27448 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
MARK3P27448 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms