Protein–RNA interactions for Protein: P26196

DDX6, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX6P26196 PHF23-207ENST00000573826 685 ntTSL 320.74■□□□□ 0.914e-11■■■■■ 46.6
DDX6P26196 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.98e-7■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ZNF599-204ENST00000588788 1386 ntTSL 520.62■□□□□ 0.895e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.895e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.875e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.875e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.865e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ACTR10-204ENST00000554402 1544 ntTSL 1 (best)20.4■□□□□ 0.865e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 CHCHD6-207ENST00000514908 713 ntTSL 320.34■□□□□ 0.855e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.845e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 UBE2J2-220ENST00000509720 472 ntTSL 320.27■□□□□ 0.843e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.822e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.825e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 PBX3-211ENST00000497091 425 ntTSL 520.15■□□□□ 0.825e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 UBE2J2-217ENST00000491779 611 ntTSL 220.13■□□□□ 0.814e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 UBE2J2-211ENST00000466752 886 ntTSL 320.13■□□□□ 0.814e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 UBE2J2-216ENST00000488418 750 ntTSL 220.09■□□□□ 0.815e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.85e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 CHCHD6-202ENST00000503119 1148 ntTSL 1 (best)20.04■□□□□ 0.85e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.795e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.795e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.785e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.785e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 EIF5-215ENST00000560763 723 ntTSL 219.87■□□□□ 0.775e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.773e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.761e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 SARM1-201ENST00000379061 1921 ntTSL 219.75■□□□□ 0.755e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 AKR7A2-202ENST00000330072 1171 ntTSL 219.74■□□□□ 0.755e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TCF3-216ENST00000592395 996 ntTSL 519.74■□□□□ 0.753e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 WDR4-207ENST00000492742 2205 ntTSL 219.67■□□□□ 0.745e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 PHF23-206ENST00000572789 1006 ntTSL 219.57■□□□□ 0.724e-11■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ACTR10-207ENST00000555229 1517 ntTSL 519.51■□□□□ 0.715e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.713e-7■■■■■ 46.6
DDX6P26196 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.695e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.695e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 PBX3-205ENST00000373492 950 ntTSL 1 (best)19.34■□□□□ 0.695e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 PBX3-202ENST00000373482 1130 ntTSL 1 (best)19.33■□□□□ 0.685e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 DVL1-203ENST00000472445 639 ntTSL 219.31■□□□□ 0.684e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TCF7-210ENST00000518887 584 ntTSL 219.31■□□□□ 0.685e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.685e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.684e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.673e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ZGPAT-211ENST00000484569 749 ntTSL 219.23■□□□□ 0.675e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.673e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 QTRT1-202ENST00000421333 1502 ntTSL 219.19■□□□□ 0.665e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.655e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 REPIN1-216ENST00000518462 621 ntTSL 419.1■□□□□ 0.655e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TMEM260-203ENST00000539559 2680 ntTSL 1 (best)18.97■□□□□ 0.635e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.625e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TSPAN14-208ENST00000469149 959 ntTSL 218.91■□□□□ 0.625e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.63e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.595e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.595e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.585e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.585e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.585e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.575e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 GPAT4-209ENST00000521349 842 ntTSL 218.61■□□□□ 0.575e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 GPAT4-202ENST00000518628 1063 ntTSL 318.61■□□□□ 0.575e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 PBX3-209ENST00000491787 875 ntTSL 518.6■□□□□ 0.575e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.565e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.565e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.555e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 PRKCZ-226ENST00000505322 1859 ntTSL 218.44■□□□□ 0.545e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ZGPAT-210ENST00000478385 935 ntTSL 218.35■□□□□ 0.535e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 EIF5-214ENST00000560338 580 ntTSL 318.3■□□□□ 0.525e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 RBM38-202ENST00000344785 2193 ntTSL 518.23■□□□□ 0.511e-8■■■■■ 46.6
DDX6P26196 MAP2K7-206ENST00000475022 1519 ntTSL 1 (best)18.16■□□□□ 0.55e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.495e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.495e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.465e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TSPAN9-204ENST00000444315 570 ntTSL 417.87■□□□□ 0.455e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.435e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.435e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.435e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 DCTD-203ENST00000500813 1829 ntTSL 217.7■□□□□ 0.425e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.425e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.415e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 PATZ1-205ENST00000465287 1702 ntTSL 217.64■□□□□ 0.415e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 WDR1-206ENST00000502962 1411 ntTSL 517.63■□□□□ 0.415e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 RUSC2-201ENST00000361226 5199 ntAPPRIS P1 TSL 217.6■□□□□ 0.415e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.412e-8■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.45e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.395e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 EIF5-210ENST00000559249 704 ntTSL 217.44■□□□□ 0.385e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 POMT2-202ENST00000452340 5647 ntTSL 217.41■□□□□ 0.385e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.388e-7■■■■■ 46.6
DDX6P26196 PRKCZ-204ENST00000461106 1916 ntTSL 217.41■□□□□ 0.385e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.371e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 AKAP10-207ENST00000572341 559 ntTSL 417.36■□□□□ 0.375e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.375e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.375e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.364e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.364e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.364e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 UBE2J2-218ENST00000502382 530 ntTSL 417.18■□□□□ 0.344e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 CCDC88C-209ENST00000554872 1165 ntTSL 417.17■□□□□ 0.345e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ANKRD11-210ENST00000566858 580 ntTSL 417.17■□□□□ 0.345e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 AKAP10-208ENST00000576896 565 ntTSL 417.16■□□□□ 0.345e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 AKAP10-205ENST00000571858 564 ntTSL 417.16■□□□□ 0.345e-6■■■■■ 46.6
Retrieved 100 of 14,483 protein–RNA pairs in 218.3 ms