Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSSP25774 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSSP25774 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSSP25774 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSSP25774 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSSP25774 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSSP25774 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSSP25774 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSSP25774 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSSP25774 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSSP25774 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSSP25774 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSSP25774 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSSP25774 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSSP25774 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSSP25774 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSSP25774 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSSP25774 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSSP25774 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSSP25774 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSSP25774 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSSP25774 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSSP25774 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSSP25774 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSSP25774 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSSP25774 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSSP25774 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSSP25774 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CTSSP25774 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTSSP25774 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTSSP25774 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSSP25774 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSSP25774 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSSP25774 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSSP25774 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSSP25774 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSSP25774 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSSP25774 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSSP25774 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSSP25774 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSSP25774 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSSP25774 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSSP25774 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSSP25774 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSSP25774 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSSP25774 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSSP25774 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSSP25774 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSSP25774 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSSP25774 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSSP25774 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSSP25774 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSSP25774 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSSP25774 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSSP25774 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSSP25774 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSSP25774 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSSP25774 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSSP25774 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSSP25774 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSSP25774 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSSP25774 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSSP25774 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSSP25774 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSSP25774 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSSP25774 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSSP25774 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSSP25774 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSSP25774 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSSP25774 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSSP25774 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSSP25774 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSSP25774 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSSP25774 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSSP25774 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSSP25774 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSSP25774 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSSP25774 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSSP25774 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSSP25774 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSSP25774 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSSP25774 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSSP25774 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSSP25774 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSSP25774 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSSP25774 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSSP25774 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSSP25774 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSSP25774 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSSP25774 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSSP25774 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSSP25774 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSSP25774 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSSP25774 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSSP25774 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSSP25774 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSSP25774 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSSP25774 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSSP25774 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSSP25774 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms