Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD247P20963 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD247P20963 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CD247P20963 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD247P20963 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD247P20963 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD247P20963 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD247P20963 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD247P20963 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD247P20963 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD247P20963 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD247P20963 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD247P20963 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD247P20963 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD247P20963 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD247P20963 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD247P20963 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD247P20963 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD247P20963 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD247P20963 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD247P20963 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD247P20963 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD247P20963 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD247P20963 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD247P20963 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD247P20963 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD247P20963 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD247P20963 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD247P20963 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CD247P20963 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD247P20963 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD247P20963 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD247P20963 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CD247P20963 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD247P20963 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD247P20963 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CD247P20963 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD247P20963 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD247P20963 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD247P20963 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD247P20963 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD247P20963 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CD247P20963 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD247P20963 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CD247P20963 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD247P20963 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD247P20963 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD247P20963 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD247P20963 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CD247P20963 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD247P20963 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD247P20963 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD247P20963 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD247P20963 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD247P20963 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD247P20963 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CD247P20963 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD247P20963 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD247P20963 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD247P20963 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD247P20963 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD247P20963 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD247P20963 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD247P20963 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD247P20963 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD247P20963 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CD247P20963 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD247P20963 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD247P20963 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD247P20963 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CD247P20963 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CD247P20963 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD247P20963 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD247P20963 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD247P20963 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD247P20963 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD247P20963 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD247P20963 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD247P20963 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD247P20963 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD247P20963 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD247P20963 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD247P20963 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD247P20963 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD247P20963 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD247P20963 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD247P20963 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD247P20963 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD247P20963 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD247P20963 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD247P20963 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD247P20963 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD247P20963 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD247P20963 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD247P20963 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD247P20963 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD247P20963 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD247P20963 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD247P20963 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD247P20963 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms