Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB4AP20338 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB4AP20338 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB4AP20338 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB4AP20338 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB4AP20338 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB4AP20338 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB4AP20338 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB4AP20338 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB4AP20338 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB4AP20338 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB4AP20338 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB4AP20338 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB4AP20338 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB4AP20338 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB4AP20338 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB4AP20338 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB4AP20338 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB4AP20338 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB4AP20338 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB4AP20338 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB4AP20338 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB4AP20338 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB4AP20338 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB4AP20338 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB4AP20338 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB4AP20338 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB4AP20338 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB4AP20338 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB4AP20338 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB4AP20338 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB4AP20338 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB4AP20338 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB4AP20338 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB4AP20338 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB4AP20338 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB4AP20338 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB4AP20338 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB4AP20338 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB4AP20338 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB4AP20338 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB4AP20338 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB4AP20338 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB4AP20338 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB4AP20338 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB4AP20338 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB4AP20338 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB4AP20338 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB4AP20338 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB4AP20338 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB4AP20338 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB4AP20338 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB4AP20338 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB4AP20338 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB4AP20338 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB4AP20338 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB4AP20338 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB4AP20338 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB4AP20338 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB4AP20338 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB4AP20338 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB4AP20338 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB4AP20338 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB4AP20338 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB4AP20338 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB4AP20338 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB4AP20338 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB4AP20338 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB4AP20338 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB4AP20338 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB4AP20338 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB4AP20338 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB4AP20338 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB4AP20338 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB4AP20338 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB4AP20338 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB4AP20338 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB4AP20338 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB4AP20338 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB4AP20338 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB4AP20338 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB4AP20338 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB4AP20338 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB4AP20338 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB4AP20338 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB4AP20338 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB4AP20338 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB4AP20338 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB4AP20338 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB4AP20338 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB4AP20338 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB4AP20338 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB4AP20338 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB4AP20338 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB4AP20338 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB4AP20338 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB4AP20338 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB4AP20338 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB4AP20338 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB4AP20338 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms