Protein–RNA interactions for Protein: P20333

TNFRSF1B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF1BP20333 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF1BP20333 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF1BP20333 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF1BP20333 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF1BP20333 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF1BP20333 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF1BP20333 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF1BP20333 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF1BP20333 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNFRSF1BP20333 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNFRSF1BP20333 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF1BP20333 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF1BP20333 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF1BP20333 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF1BP20333 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFRSF1BP20333 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFRSF1BP20333 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFRSF1BP20333 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFRSF1BP20333 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFRSF1BP20333 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFRSF1BP20333 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFRSF1BP20333 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF1BP20333 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF1BP20333 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF1BP20333 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF1BP20333 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF1BP20333 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF1BP20333 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF1BP20333 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF1BP20333 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF1BP20333 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF1BP20333 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF1BP20333 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF1BP20333 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF1BP20333 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF1BP20333 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF1BP20333 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF1BP20333 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF1BP20333 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF1BP20333 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF1BP20333 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF1BP20333 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF1BP20333 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF1BP20333 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF1BP20333 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF1BP20333 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF1BP20333 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF1BP20333 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF1BP20333 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF1BP20333 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF1BP20333 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF1BP20333 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF1BP20333 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF1BP20333 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF1BP20333 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFRSF1BP20333 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFRSF1BP20333 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFRSF1BP20333 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFRSF1BP20333 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF1BP20333 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF1BP20333 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF1BP20333 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF1BP20333 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF1BP20333 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF1BP20333 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF1BP20333 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF1BP20333 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF1BP20333 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFRSF1BP20333 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFRSF1BP20333 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFRSF1BP20333 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFRSF1BP20333 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF1BP20333 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF1BP20333 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF1BP20333 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF1BP20333 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF1BP20333 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF1BP20333 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF1BP20333 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF1BP20333 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF1BP20333 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFRSF1BP20333 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFRSF1BP20333 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFRSF1BP20333 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFRSF1BP20333 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF1BP20333 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF1BP20333 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNFRSF1BP20333 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNFRSF1BP20333 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFRSF1BP20333 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFRSF1BP20333 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFRSF1BP20333 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFRSF1BP20333 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFRSF1BP20333 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFRSF1BP20333 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFRSF1BP20333 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFRSF1BP20333 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF1BP20333 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF1BP20333 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF1BP20333 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms