Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPL17P18621 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPL17P18621 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPL17P18621 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPL17P18621 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPL17P18621 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPL17P18621 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPL17P18621 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RPL17P18621 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPL17P18621 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPL17P18621 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RPL17P18621 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPL17P18621 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPL17P18621 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPL17P18621 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RPL17P18621 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPL17P18621 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RPL17P18621 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPL17P18621 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RPL17P18621 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPL17P18621 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RPL17P18621 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPL17P18621 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPL17P18621 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RPL17P18621 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPL17P18621 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPL17P18621 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPL17P18621 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RPL17P18621 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPL17P18621 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPL17P18621 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPL17P18621 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPL17P18621 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPL17P18621 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPL17P18621 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
RPL17P18621 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPL17P18621 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RPL17P18621 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPL17P18621 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPL17P18621 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPL17P18621 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPL17P18621 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPL17P18621 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPL17P18621 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPL17P18621 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPL17P18621 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPL17P18621 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPL17P18621 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPL17P18621 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPL17P18621 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPL17P18621 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPL17P18621 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RPL17P18621 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPL17P18621 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPL17P18621 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPL17P18621 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPL17P18621 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPL17P18621 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPL17P18621 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RPL17P18621 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPL17P18621 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RPL17P18621 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPL17P18621 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPL17P18621 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPL17P18621 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPL17P18621 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPL17P18621 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPL17P18621 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPL17P18621 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPL17P18621 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPL17P18621 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPL17P18621 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPL17P18621 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPL17P18621 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPL17P18621 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RPL17P18621 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPL17P18621 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPL17P18621 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPL17P18621 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPL17P18621 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPL17P18621 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPL17P18621 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPL17P18621 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPL17P18621 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPL17P18621 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPL17P18621 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPL17P18621 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPL17P18621 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPL17P18621 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RPL17P18621 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPL17P18621 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPL17P18621 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPL17P18621 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RPL17P18621 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPL17P18621 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPL17P18621 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPL17P18621 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPL17P18621 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPL17P18621 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RPL17P18621 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms