Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
XBP1P17861 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
XBP1P17861 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
XBP1P17861 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
XBP1P17861 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
XBP1P17861 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
XBP1P17861 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
XBP1P17861 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
XBP1P17861 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
XBP1P17861 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
XBP1P17861 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
XBP1P17861 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
XBP1P17861 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
XBP1P17861 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
XBP1P17861 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
XBP1P17861 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
XBP1P17861 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
XBP1P17861 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
XBP1P17861 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
XBP1P17861 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
XBP1P17861 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
XBP1P17861 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
XBP1P17861 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
XBP1P17861 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
XBP1P17861 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
XBP1P17861 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
XBP1P17861 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
XBP1P17861 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
XBP1P17861 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
XBP1P17861 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
XBP1P17861 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
XBP1P17861 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
XBP1P17861 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
XBP1P17861 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
XBP1P17861 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
XBP1P17861 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
XBP1P17861 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
XBP1P17861 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
XBP1P17861 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
XBP1P17861 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
XBP1P17861 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
XBP1P17861 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
XBP1P17861 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29■■■□□ 2.23
XBP1P17861 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
XBP1P17861 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
XBP1P17861 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
XBP1P17861 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
XBP1P17861 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
XBP1P17861 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
XBP1P17861 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
XBP1P17861 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
XBP1P17861 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
XBP1P17861 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
XBP1P17861 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
XBP1P17861 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
XBP1P17861 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
XBP1P17861 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
XBP1P17861 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
XBP1P17861 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
XBP1P17861 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
XBP1P17861 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
XBP1P17861 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
XBP1P17861 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
XBP1P17861 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
XBP1P17861 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
XBP1P17861 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
XBP1P17861 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
XBP1P17861 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
XBP1P17861 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
XBP1P17861 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
XBP1P17861 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
XBP1P17861 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
XBP1P17861 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
XBP1P17861 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
XBP1P17861 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
XBP1P17861 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
XBP1P17861 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
XBP1P17861 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
XBP1P17861 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
XBP1P17861 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
XBP1P17861 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
XBP1P17861 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
XBP1P17861 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
XBP1P17861 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
XBP1P17861 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
XBP1P17861 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
XBP1P17861 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
XBP1P17861 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
XBP1P17861 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
XBP1P17861 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
XBP1P17861 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
XBP1P17861 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
XBP1P17861 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
XBP1P17861 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
XBP1P17861 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
XBP1P17861 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
XBP1P17861 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
XBP1P17861 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
XBP1P17861 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
XBP1P17861 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 281.5 ms