Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AMD1P17707 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AMD1P17707 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AMD1P17707 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AMD1P17707 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AMD1P17707 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AMD1P17707 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AMD1P17707 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AMD1P17707 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AMD1P17707 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AMD1P17707 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AMD1P17707 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AMD1P17707 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AMD1P17707 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AMD1P17707 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AMD1P17707 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AMD1P17707 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AMD1P17707 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AMD1P17707 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AMD1P17707 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AMD1P17707 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AMD1P17707 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
AMD1P17707 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AMD1P17707 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AMD1P17707 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AMD1P17707 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AMD1P17707 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AMD1P17707 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AMD1P17707 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AMD1P17707 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AMD1P17707 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AMD1P17707 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AMD1P17707 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMD1P17707 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMD1P17707 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMD1P17707 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMD1P17707 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMD1P17707 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMD1P17707 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMD1P17707 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMD1P17707 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMD1P17707 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMD1P17707 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMD1P17707 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMD1P17707 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMD1P17707 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMD1P17707 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMD1P17707 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AMD1P17707 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AMD1P17707 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AMD1P17707 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AMD1P17707 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AMD1P17707 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AMD1P17707 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AMD1P17707 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AMD1P17707 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AMD1P17707 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AMD1P17707 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AMD1P17707 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AMD1P17707 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AMD1P17707 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AMD1P17707 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AMD1P17707 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AMD1P17707 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AMD1P17707 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AMD1P17707 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AMD1P17707 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AMD1P17707 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AMD1P17707 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AMD1P17707 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AMD1P17707 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AMD1P17707 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AMD1P17707 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AMD1P17707 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AMD1P17707 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AMD1P17707 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AMD1P17707 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
AMD1P17707 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
AMD1P17707 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AMD1P17707 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AMD1P17707 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AMD1P17707 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AMD1P17707 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AMD1P17707 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AMD1P17707 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AMD1P17707 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AMD1P17707 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AMD1P17707 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AMD1P17707 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AMD1P17707 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AMD1P17707 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AMD1P17707 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AMD1P17707 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AMD1P17707 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AMD1P17707 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AMD1P17707 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AMD1P17707 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
AMD1P17707 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AMD1P17707 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AMD1P17707 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms