Protein–RNA interactions for Protein: P17677

GAP43, Neuromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAP43P17677 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GAP43P17677 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GAP43P17677 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GAP43P17677 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GAP43P17677 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GAP43P17677 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GAP43P17677 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GAP43P17677 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GAP43P17677 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GAP43P17677 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
GAP43P17677 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GAP43P17677 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GAP43P17677 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GAP43P17677 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GAP43P17677 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GAP43P17677 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GAP43P17677 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GAP43P17677 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
GAP43P17677 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
GAP43P17677 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GAP43P17677 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GAP43P17677 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GAP43P17677 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GAP43P17677 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GAP43P17677 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
GAP43P17677 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GAP43P17677 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GAP43P17677 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GAP43P17677 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GAP43P17677 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GAP43P17677 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GAP43P17677 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GAP43P17677 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GAP43P17677 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GAP43P17677 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GAP43P17677 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GAP43P17677 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GAP43P17677 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GAP43P17677 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GAP43P17677 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GAP43P17677 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GAP43P17677 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GAP43P17677 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GAP43P17677 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GAP43P17677 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
GAP43P17677 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GAP43P17677 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GAP43P17677 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GAP43P17677 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GAP43P17677 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GAP43P17677 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GAP43P17677 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GAP43P17677 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GAP43P17677 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GAP43P17677 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GAP43P17677 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GAP43P17677 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GAP43P17677 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
GAP43P17677 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GAP43P17677 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GAP43P17677 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GAP43P17677 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GAP43P17677 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GAP43P17677 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
GAP43P17677 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GAP43P17677 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GAP43P17677 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GAP43P17677 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GAP43P17677 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GAP43P17677 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GAP43P17677 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GAP43P17677 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GAP43P17677 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GAP43P17677 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GAP43P17677 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GAP43P17677 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GAP43P17677 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GAP43P17677 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GAP43P17677 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GAP43P17677 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GAP43P17677 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GAP43P17677 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GAP43P17677 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GAP43P17677 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GAP43P17677 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GAP43P17677 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GAP43P17677 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GAP43P17677 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GAP43P17677 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GAP43P17677 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GAP43P17677 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GAP43P17677 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GAP43P17677 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GAP43P17677 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GAP43P17677 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GAP43P17677 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GAP43P17677 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GAP43P17677 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GAP43P17677 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GAP43P17677 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms