Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCF3P15923 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCF3P15923 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCF3P15923 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TCF3P15923 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCF3P15923 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCF3P15923 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCF3P15923 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCF3P15923 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCF3P15923 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCF3P15923 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCF3P15923 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCF3P15923 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCF3P15923 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCF3P15923 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TCF3P15923 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TCF3P15923 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCF3P15923 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TCF3P15923 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCF3P15923 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCF3P15923 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCF3P15923 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCF3P15923 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCF3P15923 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCF3P15923 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCF3P15923 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCF3P15923 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TCF3P15923 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCF3P15923 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCF3P15923 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCF3P15923 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCF3P15923 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCF3P15923 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCF3P15923 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCF3P15923 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCF3P15923 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCF3P15923 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCF3P15923 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCF3P15923 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCF3P15923 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCF3P15923 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TCF3P15923 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCF3P15923 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCF3P15923 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCF3P15923 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCF3P15923 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCF3P15923 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCF3P15923 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCF3P15923 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCF3P15923 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCF3P15923 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TCF3P15923 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCF3P15923 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCF3P15923 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCF3P15923 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCF3P15923 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCF3P15923 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCF3P15923 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCF3P15923 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCF3P15923 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCF3P15923 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCF3P15923 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCF3P15923 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCF3P15923 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCF3P15923 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TCF3P15923 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TCF3P15923 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TCF3P15923 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TCF3P15923 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TCF3P15923 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TCF3P15923 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TCF3P15923 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TCF3P15923 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TCF3P15923 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TCF3P15923 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TCF3P15923 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TCF3P15923 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TCF3P15923 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TCF3P15923 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TCF3P15923 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TCF3P15923 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCF3P15923 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCF3P15923 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCF3P15923 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCF3P15923 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCF3P15923 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCF3P15923 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TCF3P15923 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCF3P15923 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCF3P15923 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCF3P15923 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCF3P15923 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TCF3P15923 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TCF3P15923 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TCF3P15923 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TCF3P15923 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TCF3P15923 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCF3P15923 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCF3P15923 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCF3P15923 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms