Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRA1P14867 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRA1P14867 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRA1P14867 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRA1P14867 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRA1P14867 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRA1P14867 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRA1P14867 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRA1P14867 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRA1P14867 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRA1P14867 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRA1P14867 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRA1P14867 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRA1P14867 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRA1P14867 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRA1P14867 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRA1P14867 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRA1P14867 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRA1P14867 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRA1P14867 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRA1P14867 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRA1P14867 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRA1P14867 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRA1P14867 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRA1P14867 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRA1P14867 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRA1P14867 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRA1P14867 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRA1P14867 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRA1P14867 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRA1P14867 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRA1P14867 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GABRA1P14867 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRA1P14867 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRA1P14867 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRA1P14867 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRA1P14867 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRA1P14867 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRA1P14867 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRA1P14867 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRA1P14867 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRA1P14867 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRA1P14867 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRA1P14867 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRA1P14867 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRA1P14867 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRA1P14867 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRA1P14867 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRA1P14867 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRA1P14867 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRA1P14867 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRA1P14867 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRA1P14867 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRA1P14867 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRA1P14867 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRA1P14867 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRA1P14867 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRA1P14867 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRA1P14867 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRA1P14867 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRA1P14867 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GABRA1P14867 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRA1P14867 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRA1P14867 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRA1P14867 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRA1P14867 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRA1P14867 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRA1P14867 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRA1P14867 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRA1P14867 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRA1P14867 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRA1P14867 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRA1P14867 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRA1P14867 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRA1P14867 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRA1P14867 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRA1P14867 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRA1P14867 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRA1P14867 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRA1P14867 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRA1P14867 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRA1P14867 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRA1P14867 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRA1P14867 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRA1P14867 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRA1P14867 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRA1P14867 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRA1P14867 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRA1P14867 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GABRA1P14867 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GABRA1P14867 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GABRA1P14867 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRA1P14867 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRA1P14867 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRA1P14867 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRA1P14867 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRA1P14867 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRA1P14867 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRA1P14867 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRA1P14867 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms