Protein–RNA interactions for Protein: P13647

KRT5, Keratin, type II cytoskeletal 5, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT5P13647 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT5P13647 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT5P13647 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT5P13647 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT5P13647 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT5P13647 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27■■□□□ 1.91
KRT5P13647 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27■■□□□ 1.91
KRT5P13647 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27■■□□□ 1.91
KRT5P13647 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT5P13647 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT5P13647 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT5P13647 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT5P13647 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT5P13647 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT5P13647 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT5P13647 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT5P13647 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT5P13647 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT5P13647 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT5P13647 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT5P13647 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT5P13647 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT5P13647 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT5P13647 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT5P13647 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT5P13647 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT5P13647 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT5P13647 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT5P13647 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT5P13647 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT5P13647 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT5P13647 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KRT5P13647 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT5P13647 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT5P13647 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT5P13647 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT5P13647 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT5P13647 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT5P13647 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT5P13647 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT5P13647 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT5P13647 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT5P13647 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT5P13647 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT5P13647 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT5P13647 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT5P13647 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT5P13647 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT5P13647 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT5P13647 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT5P13647 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT5P13647 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT5P13647 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT5P13647 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT5P13647 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT5P13647 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT5P13647 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT5P13647 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT5P13647 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT5P13647 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT5P13647 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT5P13647 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT5P13647 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT5P13647 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT5P13647 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT5P13647 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT5P13647 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT5P13647 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT5P13647 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT5P13647 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT5P13647 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT5P13647 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT5P13647 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT5P13647 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT5P13647 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT5P13647 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT5P13647 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT5P13647 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT5P13647 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT5P13647 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT5P13647 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT5P13647 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT5P13647 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT5P13647 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT5P13647 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT5P13647 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT5P13647 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT5P13647 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT5P13647 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT5P13647 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT5P13647 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT5P13647 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT5P13647 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT5P13647 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT5P13647 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT5P13647 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT5P13647 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT5P13647 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT5P13647 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT5P13647 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms