Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC44.39■■■■■ 4.7
CFTRP13569 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.7
CFTRP13569 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
CFTRP13569 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
CFTRP13569 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
CFTRP13569 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC44.38■■■■■ 4.69
CFTRP13569 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
CFTRP13569 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC44.37■■■■■ 4.69
CFTRP13569 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC44.37■■■■■ 4.69
CFTRP13569 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.37■■■■■ 4.69
CFTRP13569 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.36■■■■■ 4.69
CFTRP13569 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.36■■■■■ 4.69
CFTRP13569 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC44.36■■■■■ 4.69
CFTRP13569 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
CFTRP13569 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC44.35■■■■■ 4.69
CFTRP13569 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC44.34■■■■■ 4.69
CFTRP13569 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC44.34■■■■■ 4.69
CFTRP13569 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
CFTRP13569 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC44.33■■■■■ 4.69
CFTRP13569 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC44.33■■■■■ 4.69
CFTRP13569 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
CFTRP13569 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
CFTRP13569 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC44.31■■■■■ 4.68
CFTRP13569 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
CFTRP13569 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC44.31■■■■■ 4.68
CFTRP13569 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
CFTRP13569 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
CFTRP13569 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
CFTRP13569 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
CFTRP13569 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
CFTRP13569 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
CFTRP13569 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.28■■■■■ 4.68
CFTRP13569 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC44.28■■■■■ 4.68
CFTRP13569 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
CFTRP13569 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
CFTRP13569 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
CFTRP13569 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC44.27■■■■■ 4.68
CFTRP13569 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
CFTRP13569 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
CFTRP13569 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
CFTRP13569 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
CFTRP13569 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
CFTRP13569 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
CFTRP13569 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
CFTRP13569 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
CFTRP13569 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC44.25■■■■■ 4.67
CFTRP13569 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC44.24■■■■■ 4.67
CFTRP13569 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
CFTRP13569 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
CFTRP13569 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC44.22■■■■■ 4.67
CFTRP13569 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC44.22■■■■■ 4.67
CFTRP13569 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
CFTRP13569 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC44.21■■■■■ 4.67
CFTRP13569 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC44.21■■■■■ 4.67
CFTRP13569 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.21■■■■■ 4.67
CFTRP13569 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC44.2■■■■■ 4.67
CFTRP13569 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC44.2■■■■■ 4.67
CFTRP13569 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
CFTRP13569 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC44.18■■■■■ 4.66
CFTRP13569 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.17■■■■■ 4.66
CFTRP13569 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC44.16■■■■■ 4.66
CFTRP13569 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC44.15■■■■■ 4.66
CFTRP13569 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
CFTRP13569 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
CFTRP13569 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
CFTRP13569 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
CFTRP13569 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC44.14■■■■■ 4.66
CFTRP13569 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
CFTRP13569 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.12■■■■■ 4.65
CFTRP13569 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC44.12■■■■■ 4.65
CFTRP13569 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
CFTRP13569 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC44.11■■■■■ 4.65
CFTRP13569 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC44.1■■■■■ 4.65
CFTRP13569 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC44.08■■■■■ 4.65
CFTRP13569 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC44.08■■■■■ 4.65
CFTRP13569 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
CFTRP13569 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.08■■■■■ 4.65
CFTRP13569 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC44.08■■■■■ 4.65
CFTRP13569 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
CFTRP13569 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.06■■■■■ 4.64
CFTRP13569 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
CFTRP13569 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC44.04■■■■■ 4.64
CFTRP13569 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.04■■■■■ 4.64
CFTRP13569 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC44.04■■■■■ 4.64
CFTRP13569 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC44.02■■■■■ 4.64
CFTRP13569 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
CFTRP13569 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
CFTRP13569 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC44.01■■■■■ 4.64
CFTRP13569 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.01■■■■■ 4.64
CFTRP13569 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC44.01■■■■■ 4.64
CFTRP13569 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
CFTRP13569 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC44.01■■■■■ 4.64
CFTRP13569 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC43.99■■■■■ 4.63
CFTRP13569 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
CFTRP13569 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC43.98■■■■■ 4.63
CFTRP13569 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
CFTRP13569 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC43.98■■■■■ 4.63
CFTRP13569 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC43.98■■■■■ 4.63
CFTRP13569 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.98■■■■■ 4.63
CFTRP13569 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms