Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL6A2P12110 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL6A2P12110 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL6A2P12110 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL6A2P12110 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL6A2P12110 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL6A2P12110 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL6A2P12110 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL6A2P12110 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL6A2P12110 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL6A2P12110 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL6A2P12110 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
COL6A2P12110 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL6A2P12110 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL6A2P12110 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL6A2P12110 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL6A2P12110 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL6A2P12110 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL6A2P12110 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL6A2P12110 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL6A2P12110 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
COL6A2P12110 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
COL6A2P12110 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL6A2P12110 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL6A2P12110 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL6A2P12110 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL6A2P12110 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL6A2P12110 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL6A2P12110 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL6A2P12110 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL6A2P12110 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL6A2P12110 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL6A2P12110 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL6A2P12110 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL6A2P12110 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL6A2P12110 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL6A2P12110 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL6A2P12110 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL6A2P12110 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL6A2P12110 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL6A2P12110 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL6A2P12110 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL6A2P12110 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL6A2P12110 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL6A2P12110 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL6A2P12110 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL6A2P12110 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL6A2P12110 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL6A2P12110 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL6A2P12110 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL6A2P12110 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL6A2P12110 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL6A2P12110 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL6A2P12110 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL6A2P12110 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL6A2P12110 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL6A2P12110 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL6A2P12110 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL6A2P12110 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL6A2P12110 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL6A2P12110 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL6A2P12110 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL6A2P12110 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL6A2P12110 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL6A2P12110 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL6A2P12110 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL6A2P12110 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL6A2P12110 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
COL6A2P12110 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
COL6A2P12110 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL6A2P12110 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL6A2P12110 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL6A2P12110 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
COL6A2P12110 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
COL6A2P12110 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL6A2P12110 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL6A2P12110 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL6A2P12110 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL6A2P12110 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL6A2P12110 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL6A2P12110 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL6A2P12110 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL6A2P12110 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
COL6A2P12110 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL6A2P12110 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL6A2P12110 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL6A2P12110 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL6A2P12110 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL6A2P12110 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL6A2P12110 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL6A2P12110 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL6A2P12110 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL6A2P12110 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL6A2P12110 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL6A2P12110 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL6A2P12110 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL6A2P12110 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
COL6A2P12110 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL6A2P12110 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL6A2P12110 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms