Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TOP1P11387 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TOP1P11387 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
TOP1P11387 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TOP1P11387 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
TOP1P11387 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TOP1P11387 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TOP1P11387 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TOP1P11387 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TOP1P11387 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TOP1P11387 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TOP1P11387 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TOP1P11387 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TOP1P11387 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TOP1P11387 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TOP1P11387 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TOP1P11387 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TOP1P11387 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
TOP1P11387 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TOP1P11387 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TOP1P11387 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TOP1P11387 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TOP1P11387 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOP1P11387 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOP1P11387 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOP1P11387 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOP1P11387 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOP1P11387 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOP1P11387 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOP1P11387 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOP1P11387 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOP1P11387 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TOP1P11387 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TOP1P11387 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TOP1P11387 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP1P11387 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP1P11387 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP1P11387 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP1P11387 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP1P11387 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TOP1P11387 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TOP1P11387 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TOP1P11387 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
TOP1P11387 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TOP1P11387 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TOP1P11387 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TOP1P11387 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOP1P11387 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOP1P11387 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TOP1P11387 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TOP1P11387 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TOP1P11387 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TOP1P11387 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TOP1P11387 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TOP1P11387 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TOP1P11387 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TOP1P11387 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TOP1P11387 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TOP1P11387 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TOP1P11387 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TOP1P11387 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TOP1P11387 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TOP1P11387 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TOP1P11387 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TOP1P11387 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TOP1P11387 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TOP1P11387 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
TOP1P11387 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TOP1P11387 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TOP1P11387 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TOP1P11387 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TOP1P11387 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TOP1P11387 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TOP1P11387 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TOP1P11387 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TOP1P11387 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TOP1P11387 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TOP1P11387 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TOP1P11387 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOP1P11387 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOP1P11387 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOP1P11387 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOP1P11387 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOP1P11387 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TOP1P11387 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOP1P11387 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOP1P11387 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOP1P11387 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOP1P11387 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TOP1P11387 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TOP1P11387 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TOP1P11387 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TOP1P11387 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP1P11387 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP1P11387 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP1P11387 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TOP1P11387 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TOP1P11387 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TOP1P11387 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOP1P11387 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms