Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRGAP2CP0DJJ0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRGAP2CP0DJJ0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SRGAP2CP0DJJ0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SRGAP2CP0DJJ0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRGAP2CP0DJJ0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRGAP2CP0DJJ0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRGAP2CP0DJJ0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRGAP2CP0DJJ0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRGAP2CP0DJJ0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRGAP2CP0DJJ0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRGAP2CP0DJJ0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRGAP2CP0DJJ0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRGAP2CP0DJJ0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SRGAP2CP0DJJ0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SRGAP2CP0DJJ0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SRGAP2CP0DJJ0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SRGAP2CP0DJJ0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRGAP2CP0DJJ0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRGAP2CP0DJJ0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRGAP2CP0DJJ0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SRGAP2CP0DJJ0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRGAP2CP0DJJ0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRGAP2CP0DJJ0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRGAP2CP0DJJ0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRGAP2CP0DJJ0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRGAP2CP0DJJ0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRGAP2CP0DJJ0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRGAP2CP0DJJ0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SRGAP2CP0DJJ0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SRGAP2CP0DJJ0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SRGAP2CP0DJJ0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SRGAP2CP0DJJ0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SRGAP2CP0DJJ0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SRGAP2CP0DJJ0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SRGAP2CP0DJJ0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SRGAP2CP0DJJ0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SRGAP2CP0DJJ0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRGAP2CP0DJJ0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRGAP2CP0DJJ0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRGAP2CP0DJJ0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRGAP2CP0DJJ0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SRGAP2CP0DJJ0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SRGAP2CP0DJJ0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SRGAP2CP0DJJ0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SRGAP2CP0DJJ0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SRGAP2CP0DJJ0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRGAP2CP0DJJ0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRGAP2CP0DJJ0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRGAP2CP0DJJ0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRGAP2CP0DJJ0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRGAP2CP0DJJ0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRGAP2CP0DJJ0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRGAP2CP0DJJ0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SRGAP2CP0DJJ0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRGAP2CP0DJJ0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRGAP2CP0DJJ0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRGAP2CP0DJJ0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SRGAP2CP0DJJ0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRGAP2CP0DJJ0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRGAP2CP0DJJ0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SRGAP2CP0DJJ0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRGAP2CP0DJJ0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRGAP2CP0DJJ0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SRGAP2CP0DJJ0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SRGAP2CP0DJJ0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SRGAP2CP0DJJ0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SRGAP2CP0DJJ0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SRGAP2CP0DJJ0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SRGAP2CP0DJJ0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRGAP2CP0DJJ0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRGAP2CP0DJJ0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRGAP2CP0DJJ0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRGAP2CP0DJJ0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRGAP2CP0DJJ0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRGAP2CP0DJJ0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRGAP2CP0DJJ0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRGAP2CP0DJJ0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRGAP2CP0DJJ0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRGAP2CP0DJJ0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRGAP2CP0DJJ0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRGAP2CP0DJJ0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRGAP2CP0DJJ0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRGAP2CP0DJJ0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRGAP2CP0DJJ0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRGAP2CP0DJJ0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRGAP2CP0DJJ0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRGAP2CP0DJJ0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRGAP2CP0DJJ0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRGAP2CP0DJJ0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SRGAP2CP0DJJ0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SRGAP2CP0DJJ0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SRGAP2CP0DJJ0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRGAP2CP0DJJ0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRGAP2CP0DJJ0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRGAP2CP0DJJ0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRGAP2CP0DJJ0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms