Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RGPD1P0DJD0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RGPD1P0DJD0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RGPD1P0DJD0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RGPD1P0DJD0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
RGPD1P0DJD0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RGPD1P0DJD0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RGPD1P0DJD0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RGPD1P0DJD0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RGPD1P0DJD0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RGPD1P0DJD0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RGPD1P0DJD0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
RGPD1P0DJD0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
RGPD1P0DJD0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
RGPD1P0DJD0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.05
RGPD1P0DJD0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RGPD1P0DJD0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
RGPD1P0DJD0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
RGPD1P0DJD0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
RGPD1P0DJD0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RGPD1P0DJD0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RGPD1P0DJD0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RGPD1P0DJD0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RGPD1P0DJD0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RGPD1P0DJD0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RGPD1P0DJD0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RGPD1P0DJD0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RGPD1P0DJD0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RGPD1P0DJD0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RGPD1P0DJD0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RGPD1P0DJD0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RGPD1P0DJD0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RGPD1P0DJD0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RGPD1P0DJD0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RGPD1P0DJD0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
RGPD1P0DJD0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RGPD1P0DJD0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
RGPD1P0DJD0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
RGPD1P0DJD0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
RGPD1P0DJD0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
RGPD1P0DJD0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
RGPD1P0DJD0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RGPD1P0DJD0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RGPD1P0DJD0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RGPD1P0DJD0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RGPD1P0DJD0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RGPD1P0DJD0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RGPD1P0DJD0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RGPD1P0DJD0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RGPD1P0DJD0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RGPD1P0DJD0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RGPD1P0DJD0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RGPD1P0DJD0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RGPD1P0DJD0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RGPD1P0DJD0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RGPD1P0DJD0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RGPD1P0DJD0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RGPD1P0DJD0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RGPD1P0DJD0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
RGPD1P0DJD0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
RGPD1P0DJD0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RGPD1P0DJD0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RGPD1P0DJD0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RGPD1P0DJD0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RGPD1P0DJD0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RGPD1P0DJD0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RGPD1P0DJD0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RGPD1P0DJD0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RGPD1P0DJD0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
RGPD1P0DJD0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RGPD1P0DJD0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RGPD1P0DJD0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RGPD1P0DJD0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RGPD1P0DJD0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
RGPD1P0DJD0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RGPD1P0DJD0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RGPD1P0DJD0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RGPD1P0DJD0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RGPD1P0DJD0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RGPD1P0DJD0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RGPD1P0DJD0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RGPD1P0DJD0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
RGPD1P0DJD0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RGPD1P0DJD0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RGPD1P0DJD0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RGPD1P0DJD0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RGPD1P0DJD0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
RGPD1P0DJD0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RGPD1P0DJD0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RGPD1P0DJD0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RGPD1P0DJD0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RGPD1P0DJD0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RGPD1P0DJD0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RGPD1P0DJD0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
RGPD1P0DJD0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
RGPD1P0DJD0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
RGPD1P0DJD0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
RGPD1P0DJD0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RGPD1P0DJD0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
RGPD1P0DJD0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms