Protein–RNA interactions for Protein: P0CX20

YRF1-1, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-1P0CX20 GET2YER083C 858 nt10.79□□□□□ -0.68
YRF1-1P0CX20 VPS65YLR322W 315 nt10.79□□□□□ -0.68
YRF1-1P0CX20 HTZ1YOL012C 405 nt10.78□□□□□ -0.68
YRF1-1P0CX20 CCW12YLR110C 402 nt10.77□□□□□ -0.68
YRF1-1P0CX20 YPL102CYPL102C 303 nt10.77□□□□□ -0.68
YRF1-1P0CX20 ABP1YCR088W 1779 nt10.77□□□□□ -0.69
YRF1-1P0CX20 PAM17YKR065C 594 nt10.77□□□□□ -0.69
YRF1-1P0CX20 TUB1YML085C 1344 nt10.76□□□□□ -0.69
YRF1-1P0CX20 YIP4YGL198W 708 nt10.75□□□□□ -0.69
YRF1-1P0CX20 FIT2YOR382W 462 nt10.75□□□□□ -0.69
YRF1-1P0CX20 MPE1YKL059C 1326 nt10.75□□□□□ -0.69
YRF1-1P0CX20 TDA4YJR116W 840 nt10.75□□□□□ -0.69
YRF1-1P0CX20 ASR1YPR093C 867 nt10.75□□□□□ -0.69
YRF1-1P0CX20 PPH21YDL134C 1110 nt10.74□□□□□ -0.69
YRF1-1P0CX20 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt10.73□□□□□ -0.69
YRF1-1P0CX20 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt10.73□□□□□ -0.69
YRF1-1P0CX20 ASF1YJL115W 840 nt10.72□□□□□ -0.69
YRF1-1P0CX20 YJL213WYJL213W 996 nt10.72□□□□□ -0.69
YRF1-1P0CX20 CDC1YDR182W 1476 nt10.72□□□□□ -0.69
YRF1-1P0CX20 BDS1YOL164W 1941 nt10.72□□□□□ -0.69
YRF1-1P0CX20 MRPS18YNL306W 654 nt10.71□□□□□ -0.69
YRF1-1P0CX20 YNL092WYNL092W 1203 nt10.7□□□□□ -0.7
YRF1-1P0CX20 TRP2YER090W 1524 nt10.7□□□□□ -0.7
YRF1-1P0CX20 MRN1YPL184C 1839 nt10.7□□□□□ -0.7
YRF1-1P0CX20 DAL80YKR034W 810 nt10.7□□□□□ -0.7
YRF1-1P0CX20 MRP7YNL005C 1116 nt10.7□□□□□ -0.7
YRF1-1P0CX20 RRP9YPR137W 1722 nt10.69□□□□□ -0.7
YRF1-1P0CX20 HXT10YFL011W 1641 nt10.69□□□□□ -0.7
YRF1-1P0CX20 SAL1YNL083W 1485 nt10.69□□□□□ -0.7
YRF1-1P0CX20 THI6YPL214C 1623 nt10.69□□□□□ -0.7
YRF1-1P0CX20 RTC4YNL254C 1206 nt10.68□□□□□ -0.7
YRF1-1P0CX20 INH1YDL181W 258 nt10.67□□□□□ -0.7
YRF1-1P0CX20 DMC1YER179W 1005 nt10.67□□□□□ -0.7
YRF1-1P0CX20 TFG2YGR005C 1203 nt10.67□□□□□ -0.7
YRF1-1P0CX20 TPO1YLL028W 1761 nt10.66□□□□□ -0.7
YRF1-1P0CX20 YHR033WYHR033W 1272 nt10.65□□□□□ -0.71
YRF1-1P0CX20 CMP2YML057W 1815 nt10.64□□□□□ -0.71
YRF1-1P0CX20 APE4YHR113W 1473 nt10.64□□□□□ -0.71
YRF1-1P0CX20 PLB2YMR006C 2121 nt10.64□□□□□ -0.71
YRF1-1P0CX20 YMR295CYMR295C 594 nt10.64□□□□□ -0.71
YRF1-1P0CX20 TGL5YOR081C 2250 nt10.64□□□□□ -0.71
YRF1-1P0CX20 YCR049CYCR049C 447 nt10.63□□□□□ -0.71
YRF1-1P0CX20 YDR187CYDR187C 519 nt10.63□□□□□ -0.71
YRF1-1P0CX20 INM1YHR046C 888 nt10.63□□□□□ -0.71
YRF1-1P0CX20 TAF9YMR236W 474 nt10.63□□□□□ -0.71
YRF1-1P0CX20 CIT2YCR005C 1383 nt10.63□□□□□ -0.71
YRF1-1P0CX20 YKL102CYKL102C 306 nt10.62□□□□□ -0.71
YRF1-1P0CX20 YDR215CYDR215C 414 nt10.6□□□□□ -0.71
YRF1-1P0CX20 YKR045CYKR045C 552 nt10.6□□□□□ -0.71
YRF1-1P0CX20 YLR072WYLR072W 2082 nt10.59□□□□□ -0.71
YRF1-1P0CX20 UIP4YPL186C 915 nt10.59□□□□□ -0.71
YRF1-1P0CX20 RPS28AYOR167C 204 nt10.58□□□□□ -0.72
YRF1-1P0CX20 RNH201YNL072W 924 nt10.57□□□□□ -0.72
YRF1-1P0CX20 SRM1YGL097W 1449 nt10.57□□□□□ -0.72
YRF1-1P0CX20 GCG1YER163C 699 nt10.56□□□□□ -0.72
YRF1-1P0CX20 BEM1YBR200W 1656 nt10.55□□□□□ -0.72
YRF1-1P0CX20 YPQ2YDR352W 954 nt10.55□□□□□ -0.72
YRF1-1P0CX20 YMR122CYMR122C 375 nt10.55□□□□□ -0.72
YRF1-1P0CX20 ADE16YLR028C 1776 nt10.55□□□□□ -0.72
YRF1-1P0CX20 RAD59YDL059C 717 nt10.54□□□□□ -0.72
YRF1-1P0CX20 YBR113WYBR113W 483 nt10.54□□□□□ -0.72
YRF1-1P0CX20 UME6YDR207C 2511 nt10.54□□□□□ -0.72
YRF1-1P0CX20 CDA1YLR307W 906 nt10.53□□□□□ -0.72
YRF1-1P0CX20 TSR2YLR435W 618 nt10.52□□□□□ -0.72
YRF1-1P0CX20 LEA1YPL213W 717 nt10.52□□□□□ -0.72
YRF1-1P0CX20 TDH2YJR009C 999 nt10.52□□□□□ -0.73
YRF1-1P0CX20 NTG2YOL043C 1143 nt10.52□□□□□ -0.73
YRF1-1P0CX20 YMR209CYMR209C 1374 nt10.51□□□□□ -0.73
YRF1-1P0CX20 TAE1YBR261C 699 nt10.51□□□□□ -0.73
YRF1-1P0CX20 GPA2YER020W 1350 nt10.5□□□□□ -0.73
YRF1-1P0CX20 HXT11YOL156W 1704 nt10.5□□□□□ -0.73
YRF1-1P0CX20 FET5YFL041W 1869 nt10.49□□□□□ -0.73
YRF1-1P0CX20 EMP65YER140W 1671 nt10.47□□□□□ -0.73
YRF1-1P0CX20 BRN1YBL097W 2265 nt10.47□□□□□ -0.73
YRF1-1P0CX20 TOP3YLR234W 1971 nt10.47□□□□□ -0.73
YRF1-1P0CX20 LYS21YDL131W 1323 nt10.46□□□□□ -0.73
YRF1-1P0CX20 YHL018WYHL018W 363 nt10.46□□□□□ -0.74
YRF1-1P0CX20 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt10.46□□□□□ -0.74
YRF1-1P0CX20 NUP49YGL172W 1419 nt10.46□□□□□ -0.74
YRF1-1P0CX20 URA8YJR103W 1737 nt10.45□□□□□ -0.74
YRF1-1P0CX20 YLL058WYLL058W 1728 nt10.45□□□□□ -0.74
YRF1-1P0CX20 MAM3YOL060C 2121 nt10.45□□□□□ -0.74
YRF1-1P0CX20 YNR005CYNR005C 405 nt10.44□□□□□ -0.74
YRF1-1P0CX20 KTR4YBR199W 1395 nt10.44□□□□□ -0.74
YRF1-1P0CX20 CSL4YNL232W 879 nt10.43□□□□□ -0.74
YRF1-1P0CX20 ZWF1YNL241C 1518 nt10.43□□□□□ -0.74
YRF1-1P0CX20 PET117YER058W 324 nt10.42□□□□□ -0.74
YRF1-1P0CX20 MSC3YLR219W 2187 nt10.41□□□□□ -0.74
YRF1-1P0CX20 FMO1YHR176W 1299 nt10.41□□□□□ -0.74
YRF1-1P0CX20 YNL140CYNL140C 570 nt10.41□□□□□ -0.74
YRF1-1P0CX20 PET10YKR046C 852 nt10.4□□□□□ -0.74
YRF1-1P0CX20 MOG1YJR074W 657 nt10.39□□□□□ -0.75
YRF1-1P0CX20 SUF3tG(CCC)D 72 nt10.38□□□□□ -0.75
YRF1-1P0CX20 NAS6YGR232W 687 nt10.38□□□□□ -0.75
YRF1-1P0CX20 SEN34YAR008W 828 nt10.37□□□□□ -0.75
YRF1-1P0CX20 VMA3YEL027W 483 nt10.37□□□□□ -0.75
YRF1-1P0CX20 CAR2YLR438W 1275 nt10.37□□□□□ -0.75
YRF1-1P0CX20 RCF2YNR018W 675 nt10.37□□□□□ -0.75
YRF1-1P0CX20 TIF2YJL138C 1188 nt10.36□□□□□ -0.75
YRF1-1P0CX20 TIF1YKR059W 1188 nt10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 103.9 ms