Protein–RNA interactions for Protein: P0CG47

UBB, Polyubiquitin-B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBBP0CG47 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBBP0CG47 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBBP0CG47 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
UBBP0CG47 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBBP0CG47 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBBP0CG47 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBBP0CG47 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBBP0CG47 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBBP0CG47 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBBP0CG47 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBBP0CG47 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBBP0CG47 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBBP0CG47 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBBP0CG47 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBBP0CG47 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBBP0CG47 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBBP0CG47 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBBP0CG47 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBBP0CG47 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBBP0CG47 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBBP0CG47 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
UBBP0CG47 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBBP0CG47 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBBP0CG47 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBBP0CG47 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBBP0CG47 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBBP0CG47 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
UBBP0CG47 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
UBBP0CG47 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBBP0CG47 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBBP0CG47 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBBP0CG47 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBBP0CG47 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBBP0CG47 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBBP0CG47 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBBP0CG47 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBBP0CG47 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBBP0CG47 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBBP0CG47 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBBP0CG47 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBBP0CG47 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBBP0CG47 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBBP0CG47 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBBP0CG47 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBBP0CG47 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBBP0CG47 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
UBBP0CG47 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBBP0CG47 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBBP0CG47 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBBP0CG47 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBBP0CG47 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBBP0CG47 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBBP0CG47 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBBP0CG47 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBBP0CG47 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBBP0CG47 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBBP0CG47 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UBBP0CG47 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBBP0CG47 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBBP0CG47 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UBBP0CG47 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBBP0CG47 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBBP0CG47 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBBP0CG47 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBBP0CG47 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UBBP0CG47 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBBP0CG47 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBBP0CG47 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBBP0CG47 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBBP0CG47 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBBP0CG47 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
UBBP0CG47 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBBP0CG47 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBBP0CG47 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBBP0CG47 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBBP0CG47 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBBP0CG47 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBBP0CG47 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBBP0CG47 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBBP0CG47 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBBP0CG47 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBBP0CG47 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBBP0CG47 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBBP0CG47 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBBP0CG47 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
UBBP0CG47 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBBP0CG47 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBBP0CG47 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBBP0CG47 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBBP0CG47 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBBP0CG47 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBBP0CG47 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBBP0CG47 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBBP0CG47 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBBP0CG47 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBBP0CG47 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBBP0CG47 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBBP0CG47 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBBP0CG47 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBBP0CG47 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms