Protein–RNA interactions for Protein: P09455

RBP1, Retinol-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP1P09455 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBP1P09455 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBP1P09455 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBP1P09455 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBP1P09455 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBP1P09455 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RBP1P09455 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBP1P09455 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBP1P09455 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBP1P09455 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBP1P09455 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBP1P09455 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBP1P09455 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBP1P09455 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBP1P09455 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBP1P09455 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBP1P09455 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBP1P09455 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBP1P09455 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBP1P09455 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBP1P09455 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBP1P09455 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBP1P09455 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBP1P09455 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBP1P09455 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBP1P09455 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBP1P09455 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBP1P09455 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBP1P09455 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBP1P09455 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RBP1P09455 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBP1P09455 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBP1P09455 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBP1P09455 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBP1P09455 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBP1P09455 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBP1P09455 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBP1P09455 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBP1P09455 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBP1P09455 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBP1P09455 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBP1P09455 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBP1P09455 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RBP1P09455 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBP1P09455 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBP1P09455 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RBP1P09455 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RBP1P09455 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBP1P09455 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBP1P09455 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBP1P09455 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBP1P09455 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBP1P09455 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBP1P09455 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBP1P09455 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBP1P09455 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBP1P09455 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBP1P09455 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBP1P09455 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBP1P09455 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBP1P09455 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBP1P09455 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBP1P09455 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBP1P09455 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBP1P09455 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBP1P09455 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBP1P09455 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBP1P09455 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBP1P09455 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBP1P09455 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBP1P09455 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBP1P09455 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBP1P09455 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBP1P09455 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBP1P09455 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBP1P09455 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBP1P09455 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBP1P09455 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RBP1P09455 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBP1P09455 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBP1P09455 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBP1P09455 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBP1P09455 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBP1P09455 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RBP1P09455 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RBP1P09455 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RBP1P09455 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBP1P09455 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBP1P09455 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBP1P09455 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBP1P09455 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBP1P09455 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBP1P09455 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBP1P09455 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBP1P09455 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBP1P09455 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBP1P09455 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBP1P09455 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBP1P09455 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBP1P09455 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms