Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
HSP90AB1P08238 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
HSP90AB1P08238 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
HSP90AB1P08238 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
HSP90AB1P08238 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
HSP90AB1P08238 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
HSP90AB1P08238 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
HSP90AB1P08238 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
HSP90AB1P08238 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
HSP90AB1P08238 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
HSP90AB1P08238 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
HSP90AB1P08238 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
HSP90AB1P08238 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
HSP90AB1P08238 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
HSP90AB1P08238 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
HSP90AB1P08238 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
HSP90AB1P08238 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
HSP90AB1P08238 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
HSP90AB1P08238 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
HSP90AB1P08238 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
HSP90AB1P08238 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
HSP90AB1P08238 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
HSP90AB1P08238 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
HSP90AB1P08238 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
HSP90AB1P08238 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
HSP90AB1P08238 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
HSP90AB1P08238 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
HSP90AB1P08238 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
HSP90AB1P08238 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
HSP90AB1P08238 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
HSP90AB1P08238 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
HSP90AB1P08238 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
HSP90AB1P08238 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
HSP90AB1P08238 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
HSP90AB1P08238 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
HSP90AB1P08238 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
HSP90AB1P08238 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
HSP90AB1P08238 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
HSP90AB1P08238 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
HSP90AB1P08238 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
HSP90AB1P08238 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
HSP90AB1P08238 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
HSP90AB1P08238 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
HSP90AB1P08238 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
HSP90AB1P08238 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
HSP90AB1P08238 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
HSP90AB1P08238 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
HSP90AB1P08238 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
HSP90AB1P08238 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
HSP90AB1P08238 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
HSP90AB1P08238 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
HSP90AB1P08238 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
HSP90AB1P08238 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
HSP90AB1P08238 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
HSP90AB1P08238 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
HSP90AB1P08238 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
HSP90AB1P08238 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
HSP90AB1P08238 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
HSP90AB1P08238 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
HSP90AB1P08238 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
HSP90AB1P08238 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
HSP90AB1P08238 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
HSP90AB1P08238 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
HSP90AB1P08238 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
HSP90AB1P08238 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
HSP90AB1P08238 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
HSP90AB1P08238 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
HSP90AB1P08238 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
HSP90AB1P08238 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
HSP90AB1P08238 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
HSP90AB1P08238 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
HSP90AB1P08238 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
HSP90AB1P08238 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
HSP90AB1P08238 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
HSP90AB1P08238 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms