Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLBP06746 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLBP06746 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLBP06746 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLBP06746 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLBP06746 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLBP06746 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLBP06746 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLBP06746 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLBP06746 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLBP06746 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLBP06746 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLBP06746 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLBP06746 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLBP06746 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLBP06746 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLBP06746 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
POLBP06746 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLBP06746 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLBP06746 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLBP06746 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLBP06746 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLBP06746 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLBP06746 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLBP06746 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLBP06746 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLBP06746 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLBP06746 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLBP06746 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLBP06746 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLBP06746 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLBP06746 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLBP06746 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLBP06746 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLBP06746 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLBP06746 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLBP06746 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLBP06746 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLBP06746 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLBP06746 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLBP06746 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLBP06746 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLBP06746 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLBP06746 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLBP06746 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLBP06746 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLBP06746 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLBP06746 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLBP06746 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLBP06746 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLBP06746 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLBP06746 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLBP06746 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLBP06746 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLBP06746 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLBP06746 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLBP06746 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
POLBP06746 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLBP06746 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
POLBP06746 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
POLBP06746 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLBP06746 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLBP06746 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLBP06746 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLBP06746 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLBP06746 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLBP06746 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLBP06746 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLBP06746 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLBP06746 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLBP06746 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLBP06746 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLBP06746 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLBP06746 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLBP06746 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLBP06746 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLBP06746 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLBP06746 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLBP06746 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLBP06746 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLBP06746 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLBP06746 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLBP06746 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLBP06746 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLBP06746 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLBP06746 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLBP06746 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLBP06746 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLBP06746 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLBP06746 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLBP06746 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLBP06746 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLBP06746 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
POLBP06746 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLBP06746 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLBP06746 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLBP06746 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLBP06746 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
POLBP06746 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLBP06746 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms