Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB2P05107 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB2P05107 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGB2P05107 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGB2P05107 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGB2P05107 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB2P05107 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB2P05107 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB2P05107 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB2P05107 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB2P05107 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB2P05107 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB2P05107 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB2P05107 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB2P05107 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB2P05107 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB2P05107 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB2P05107 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB2P05107 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB2P05107 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB2P05107 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB2P05107 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB2P05107 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB2P05107 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB2P05107 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB2P05107 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB2P05107 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB2P05107 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB2P05107 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB2P05107 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB2P05107 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB2P05107 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB2P05107 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB2P05107 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB2P05107 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB2P05107 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB2P05107 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB2P05107 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB2P05107 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB2P05107 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB2P05107 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB2P05107 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB2P05107 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB2P05107 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB2P05107 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB2P05107 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB2P05107 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB2P05107 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB2P05107 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB2P05107 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB2P05107 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB2P05107 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB2P05107 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB2P05107 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB2P05107 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB2P05107 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB2P05107 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB2P05107 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB2P05107 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB2P05107 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB2P05107 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB2P05107 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB2P05107 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB2P05107 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB2P05107 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB2P05107 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB2P05107 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB2P05107 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB2P05107 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB2P05107 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB2P05107 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB2P05107 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB2P05107 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB2P05107 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB2P05107 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB2P05107 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB2P05107 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB2P05107 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB2P05107 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB2P05107 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB2P05107 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB2P05107 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB2P05107 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB2P05107 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB2P05107 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB2P05107 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB2P05107 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB2P05107 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB2P05107 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB2P05107 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB2P05107 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB2P05107 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB2P05107 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB2P05107 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB2P05107 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB2P05107 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB2P05107 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB2P05107 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB2P05107 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB2P05107 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms