Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
COL2A1P02458 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
COL2A1P02458 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
COL2A1P02458 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
COL2A1P02458 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
COL2A1P02458 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
COL2A1P02458 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
COL2A1P02458 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
COL2A1P02458 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
COL2A1P02458 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
COL2A1P02458 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
COL2A1P02458 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
COL2A1P02458 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
COL2A1P02458 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
COL2A1P02458 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
COL2A1P02458 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
COL2A1P02458 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
COL2A1P02458 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
COL2A1P02458 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
COL2A1P02458 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
COL2A1P02458 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
COL2A1P02458 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
COL2A1P02458 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
COL2A1P02458 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
COL2A1P02458 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
COL2A1P02458 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
COL2A1P02458 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
COL2A1P02458 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
COL2A1P02458 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
COL2A1P02458 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
COL2A1P02458 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
COL2A1P02458 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
COL2A1P02458 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
COL2A1P02458 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
COL2A1P02458 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
COL2A1P02458 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
COL2A1P02458 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
COL2A1P02458 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
COL2A1P02458 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
COL2A1P02458 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
COL2A1P02458 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
COL2A1P02458 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
COL2A1P02458 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
COL2A1P02458 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
COL2A1P02458 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
COL2A1P02458 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
COL2A1P02458 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
COL2A1P02458 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
COL2A1P02458 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
COL2A1P02458 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
COL2A1P02458 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
COL2A1P02458 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
COL2A1P02458 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
COL2A1P02458 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
COL2A1P02458 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
COL2A1P02458 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
COL2A1P02458 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
COL2A1P02458 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
COL2A1P02458 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
COL2A1P02458 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
COL2A1P02458 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
COL2A1P02458 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
COL2A1P02458 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
COL2A1P02458 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
COL2A1P02458 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
COL2A1P02458 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
COL2A1P02458 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
COL2A1P02458 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
COL2A1P02458 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
COL2A1P02458 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
COL2A1P02458 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
COL2A1P02458 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
COL2A1P02458 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
COL2A1P02458 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
COL2A1P02458 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
COL2A1P02458 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
COL2A1P02458 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
COL2A1P02458 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
COL2A1P02458 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
COL2A1P02458 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
COL2A1P02458 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
COL2A1P02458 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
COL2A1P02458 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
COL2A1P02458 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
COL2A1P02458 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
COL2A1P02458 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
COL2A1P02458 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
COL2A1P02458 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
COL2A1P02458 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
COL2A1P02458 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
COL2A1P02458 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
COL2A1P02458 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
COL2A1P02458 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
COL2A1P02458 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
COL2A1P02458 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
COL2A1P02458 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
COL2A1P02458 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
COL2A1P02458 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
COL2A1P02458 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
COL2A1P02458 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms