Protein–RNA interactions for Protein: P00480

OTC, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTCP00480 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
OTCP00480 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OTCP00480 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTCP00480 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTCP00480 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
OTCP00480 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTCP00480 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTCP00480 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTCP00480 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTCP00480 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTCP00480 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTCP00480 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTCP00480 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTCP00480 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTCP00480 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTCP00480 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTCP00480 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTCP00480 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTCP00480 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTCP00480 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTCP00480 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTCP00480 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTCP00480 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTCP00480 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTCP00480 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTCP00480 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTCP00480 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
OTCP00480 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTCP00480 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
OTCP00480 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTCP00480 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTCP00480 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTCP00480 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTCP00480 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTCP00480 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTCP00480 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
OTCP00480 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTCP00480 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTCP00480 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTCP00480 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTCP00480 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTCP00480 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTCP00480 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTCP00480 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTCP00480 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTCP00480 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTCP00480 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTCP00480 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTCP00480 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTCP00480 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTCP00480 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTCP00480 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTCP00480 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTCP00480 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTCP00480 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTCP00480 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTCP00480 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTCP00480 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTCP00480 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTCP00480 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTCP00480 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTCP00480 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTCP00480 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTCP00480 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTCP00480 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTCP00480 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTCP00480 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTCP00480 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTCP00480 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTCP00480 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTCP00480 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTCP00480 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTCP00480 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTCP00480 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTCP00480 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTCP00480 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTCP00480 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
OTCP00480 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTCP00480 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTCP00480 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTCP00480 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTCP00480 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTCP00480 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTCP00480 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTCP00480 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTCP00480 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTCP00480 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTCP00480 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTCP00480 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTCP00480 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTCP00480 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTCP00480 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTCP00480 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTCP00480 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTCP00480 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
OTCP00480 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTCP00480 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTCP00480 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTCP00480 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTCP00480 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms