Protein–RNA interactions for Protein: O96019

ACTL6A, Actin-like protein 6A, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTL6AO96019 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTL6AO96019 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTL6AO96019 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTL6AO96019 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTL6AO96019 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTL6AO96019 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTL6AO96019 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTL6AO96019 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTL6AO96019 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTL6AO96019 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTL6AO96019 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTL6AO96019 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTL6AO96019 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTL6AO96019 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTL6AO96019 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTL6AO96019 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTL6AO96019 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTL6AO96019 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTL6AO96019 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTL6AO96019 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTL6AO96019 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTL6AO96019 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTL6AO96019 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTL6AO96019 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTL6AO96019 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTL6AO96019 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTL6AO96019 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTL6AO96019 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTL6AO96019 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTL6AO96019 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTL6AO96019 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTL6AO96019 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTL6AO96019 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTL6AO96019 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ACTL6AO96019 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ACTL6AO96019 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTL6AO96019 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTL6AO96019 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTL6AO96019 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTL6AO96019 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTL6AO96019 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTL6AO96019 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTL6AO96019 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTL6AO96019 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTL6AO96019 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTL6AO96019 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTL6AO96019 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTL6AO96019 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTL6AO96019 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTL6AO96019 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTL6AO96019 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTL6AO96019 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTL6AO96019 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTL6AO96019 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTL6AO96019 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTL6AO96019 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTL6AO96019 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTL6AO96019 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTL6AO96019 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTL6AO96019 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTL6AO96019 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTL6AO96019 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTL6AO96019 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTL6AO96019 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTL6AO96019 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTL6AO96019 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTL6AO96019 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTL6AO96019 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTL6AO96019 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTL6AO96019 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTL6AO96019 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTL6AO96019 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTL6AO96019 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTL6AO96019 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTL6AO96019 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTL6AO96019 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTL6AO96019 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTL6AO96019 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTL6AO96019 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTL6AO96019 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTL6AO96019 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTL6AO96019 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTL6AO96019 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTL6AO96019 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTL6AO96019 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTL6AO96019 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTL6AO96019 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTL6AO96019 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTL6AO96019 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTL6AO96019 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTL6AO96019 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTL6AO96019 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACTL6AO96019 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACTL6AO96019 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTL6AO96019 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTL6AO96019 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTL6AO96019 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTL6AO96019 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTL6AO96019 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTL6AO96019 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms