Protein–RNA interactions for Protein: O96017

CHEK2, Serine/threonine-protein kinase Chk2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHEK2O96017 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHEK2O96017 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHEK2O96017 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHEK2O96017 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHEK2O96017 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHEK2O96017 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHEK2O96017 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHEK2O96017 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHEK2O96017 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHEK2O96017 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHEK2O96017 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHEK2O96017 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHEK2O96017 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHEK2O96017 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHEK2O96017 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHEK2O96017 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHEK2O96017 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHEK2O96017 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHEK2O96017 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHEK2O96017 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHEK2O96017 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHEK2O96017 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CHEK2O96017 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHEK2O96017 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHEK2O96017 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHEK2O96017 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHEK2O96017 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHEK2O96017 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHEK2O96017 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHEK2O96017 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHEK2O96017 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHEK2O96017 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHEK2O96017 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHEK2O96017 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHEK2O96017 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHEK2O96017 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHEK2O96017 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHEK2O96017 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHEK2O96017 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHEK2O96017 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHEK2O96017 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHEK2O96017 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHEK2O96017 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CHEK2O96017 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHEK2O96017 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHEK2O96017 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHEK2O96017 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHEK2O96017 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHEK2O96017 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHEK2O96017 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHEK2O96017 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHEK2O96017 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHEK2O96017 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHEK2O96017 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHEK2O96017 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHEK2O96017 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHEK2O96017 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHEK2O96017 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHEK2O96017 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHEK2O96017 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHEK2O96017 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHEK2O96017 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHEK2O96017 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHEK2O96017 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHEK2O96017 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHEK2O96017 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHEK2O96017 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHEK2O96017 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHEK2O96017 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHEK2O96017 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHEK2O96017 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHEK2O96017 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHEK2O96017 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHEK2O96017 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHEK2O96017 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHEK2O96017 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHEK2O96017 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHEK2O96017 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHEK2O96017 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHEK2O96017 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHEK2O96017 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHEK2O96017 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHEK2O96017 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHEK2O96017 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHEK2O96017 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHEK2O96017 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHEK2O96017 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHEK2O96017 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHEK2O96017 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHEK2O96017 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CHEK2O96017 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHEK2O96017 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHEK2O96017 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHEK2O96017 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHEK2O96017 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHEK2O96017 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHEK2O96017 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHEK2O96017 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CHEK2O96017 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHEK2O96017 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms